اعتبارات تسلسل XLEAP-SBS

قبل بدء البروتوكول، راجع المعلومات التالية لإعداد المكتبات المُخففة وإعداد عملية التشغيل. تحقيق تركيز التحميل الأمثل أمر مهم للغاية لإجراء التسلسل والتحليل بنجاح. يُساعد إدخال عدد الدورات الصحيح في إحدى القراءات في ضمان إخراج البيانات بالشكل الأمثل.

للاطلاع على المزيد من المعلومات حول التخطيط لعملية تشغيل في BaseSpace Sequence Hub، راجع BaseSpace Sequence Hub.

للحصول على معلومات حول حجم التحميل وتركيزه، راجع مولد بروتوكول تغيير الخواص والتخفيف.

عدد الدورات في إحدى القراءات

يساعد إدخال 26 دورة كحدّ أدنى و301 دورة كحدّ أقصى لكل قراءة على ضمان جودة البيانات. كما يعتمد العدد الدقيق للدورات على التجربة التي تقوم بها. يتطلّب برنامج التحكم NextSeq 1000/2000 دورة واحدة على الأقل للقراءة 1، لكنه يعرض تحذيرًا عندما يكون عدد الدورات في القراءة 1 أقل من 26.

لا يُمكن أن يزيد العدد الإجمالي للدورات في القراءة 1، والمؤشر 1، والمؤشر 2 والقراءة 2 عن عدد الدورات التي تدعمها المجموعة إضافة إلى 38 دورة. سيعرض برنامج التحكم NextSeq 1000/2000 تحذيرًا عندما يكون المؤشر 1 والمؤشر 2 أقل من 6 دورات. لا يُعرض التحذير إذا كان المؤشر 1 أو المؤشر 2 يتضمّن 0 دورة.

يتضمن عدد دورات الحد الأدنى والحد الأقصى دورة إضافية. أضف دومًا دورة واحدة إلى طول القراءة المرغوب به لتصحيح آثار المطاورة وما قبل المطاورة. يعتبر طول القراءة هو عدد دورات التسلسل في القراءة رقم 1 والقراءة رقم 2، والتي تستبعد الدورات الإضافية ودورات المؤشر. للاطلاع على المزيد من المعلومات، ارجع إلى تصحيح المطاورة في سير عمل Real-Time Analysis.

مثال على إعداد التشغيل:

•

للحصول على طول قراءة 35 (قراءة مفردة)، أدخل 36 في حقل القراءة رقم 1.

•

للحصول على طول قراءة 150 لكل قراءة (ذات نهاية مقترنة)، أدخل 151 في حقل القراءة رقم 1، و151 في حقل القراءة رقم 2.

•

للحصول على طول قراءة 300 لكل قراءة (ذات نهاية مقترنة)، أدخل 301 في حقل Read 1 (القراءة رقم 1)، و301 في حقل Read 2 (القراءة رقم 2).