Настройка на вторичния анализ
Системите за секвениране NovaSeq X и NovaSeq X PlusВи позволяват да извършвате множество анализи DRAGEN в едно изпълняване на секвениране. Преди да настроите вторичен анализ, уверете се, че сте инсталирали подходящото приложение DRAGEN на инструмента. За повече информация относно инсталирането на приложения на DRAGEN вижте Install Applications.
Можете да създадете до 12 комбинации от приложение за анализ и за референтен геном с допълнително приложение само за BCL Convert. За всяка комбинация можете да използвате до 32 конфигурации, като използвате различен комплект за приготвяне на библиотека, комплект за индексен адаптер или настройки за конфигурация за приложение за анализ и вече използвана референтна геномна комбинация.
Следните комбинации са включени в 12 конфигурационни граници:
| • | Същата версия на приложението за анализ и приложение с различен референтен геном |
| • | Същият референтен геном с различно приложение или версия на приложение |
| • | Различно приложение или версия на приложение с различен референтен геном |
Конфигурирайте вторичния анализ, както следва.
| 1. | Изберете приложение и предоставете следните настройки за конфигуриране за Вашeто изпълняване: |
| • | [Незадължително] Описание на конфигурацията |
| • | Комплект за приготвяне на библиотеки |
| • | Комплект за индексен адаптер |
| • | Референтен геном (не е приложим за DRAGEN BCL Convert) |
Когато е избран подготвителен комплект за библиотека на Illumina, секвенции на адаптера за Read 1 (Разчитане 1) и Read 2 (Разчитане 2) автоматично се попълват и не могат да бъдат променяни. Презаписването на цикли също се попълва автоматично.
| 2. | Предоставете допълнителни настройки за анализ, ако е необходимо. Наличните или задължителните настройки варират в зависимост от приложението, версията на приложението и избраните настройки за конфигуриране. За повече информация относно DRAGEN вижте страницата за поддръжка на Illumina DRAGEN Bio-IT Platform на Illumina. |
| 3. | За да въведете информация за пробата, използвайте една от следните опции: |
| • | За да импортирате информация за проба, изтеглете CSV шаблона, добавете информация за Вашата проба и импортирайте редактирания CSV файл. |
| • | Поставете идентификатори на пробите и позициите на кладенчето на индексната плака или индекси i7 и i5 директно от външен файл. Преди поставяне добавете допълнителни редове за проби, ако е необходимо. Идентификаторите на пробите може да съдържат до 20 буквено-цифрени знака, дефиси и долни черти. |
Индексните плаки с фиксирана подредба изискват въвеждания за позиции на кладенче. Индексите, които нямат фиксирана подредба, изискват въвеждания за индекси i7 и i5. Индексите i5 трябва да бъдат въведени в предна ориентация.
| • | Въведете ръчно идентификатори на пробите и съответните позиции или индекси на кладенчета. Ако Not Specified (Не е посочено) е избрано за комплекта за приготвяне на библиотеки, въведете секвенциите за Index 2 (Индекс 2) (i5) в предна ориентация. |
| 4. | Завършете конфигурацията на изпълняването. |
| • | За да редактирате подробностите за изпълняването по-късно, изберете Save as draft (Запазване като чернова). |
| • | За да финализирате подробностите за изпълняването и да направите изпълняването готово за секвениране, изберете Save as Planned (Запазване, както е планирано). |
