Laufverwaltung

Der Bildschirm Runs (Läufe) zeigt die Liste der geplanten Läufe, aktiven Läufe und abgeschlossenen Läufe an. Für alle Läufe wird der Laufname angezeigt. Um nach einem Lauf zu suchen, verwenden Sie den Laufnamen und die dem Lauf hinzugefügte Anwendung DRAGEN. Sie können auch den von allen Läufen belegten Gerätedatenspeicher und den noch verfügbaren Speicherplatz anzeigen.

Im Illumina Run Manager können Sie das Probenblatt eines Laufs exportieren. Wählen Sie den Laufnamen und dann Sample Sheet (Probenblatt). Wählen Sie Save as (Speichern unter), um das Probenblatt zu speichern.

Die Registerkarte Planned (Registerkarte Geplant) zeigt die lokal oder in der Cloud geplanten Läufe an. Sie können über Illumina Run Manager lokal auf dem MiSeq i100 Plus-Gerät Läufe planen. Sie können Läufe in der Cloud mit dem BaseSpace Sequence Hub planen.

Sie können lokal geplante Läufe unter der Registerkarte Planned (Registerkarte Geplant) bearbeiten oder löschen. Um einen geplanten Lauf zu bearbeiten, wählen Sie den Lauf unter der Registerkarte Planned (Registerkarte Geplant). Um einen geplanten Lauf zu löschen, wählen das Auslassungszeichen in der Spalte Actions (Aktionen).

Die Registerkarte Planned (Registerkarte Geplant) enthält die folgenden Informationen:

• Status – Der Status des Sequenzierungslaufs. Geplante Läufe können einen dieser Status haben:
– Planned (Geplant) – Der Lauf kann für die Sequenzierung ausgewählt werden.
– Draft (Entwurf) – Der Lauf kann nicht für die Sequenzierung ausgewählt werden.
– Needs attention (Erfordert Überprüfung) – Der Lauf ist aufgrund eines Fehlers nicht verfügbar (z. B. die Cloud-Verbindung wurde unterbrochen). Überprüfen Sie den Fehler auf dem Bildschirm Laufdetails.
• Run name (Laufname) – Der Name des Laufs.
• Application (Anwendung) – Die DRAGEN-Sekundäranalyse-Anwendung, die mit dem Lauf verknüpft ist. Weitere Informationen zur Installation von Anwendungen finden Sie unter Anwendungen.
• Last modified (Zuletzt geändert) – Datum und Uhrzeit der letzten Bearbeitung des Laufs.

Auf der Registerkarte Active (Aktiv) werden alle laufenden Läufe angezeigt. Die Registerkarte „Active“ (Aktiv) enthält das Datum des Sequenzierungsbeginns, den Sequenzierungsstatus, die Metriken % ≥ Q30, Ausbeute und Reads-PF insgesamt-Metriken.

Wählen Sie den Laufnamen aus, um zur Seite Run details (Laufdetails) zu navigieren und zusätzliche Details zum Lauf anzuzeigen. Wählen Sie die Dropdown-Liste neben dem Lauf, um zusätzliche Details zum Sequenzierungsstatus und den verknüpften DRAGEN-Anwendungen anzuzeigen.

Weitere Informationen zu Lauf-Metriken und Laufstatus finden Sie unter Überwachen des Lauffortschritts.

Die Registerkarte Completed (Abgeschlossen) zeigt Läufe an, bei denen die Sequenzierung und Analyse abgeschlossen wurden, die abgebrochen wurden oder bei denen die Sequenzierung oder Analyse fehlgeschlagen haben. Sie können den Speicherort der Sequenzierungs- und Analyseausgabedaten, die Sequenzierungsmetriken und den Gerätedatenspeicherplatz, der vom Lauf belegt wird, sehen. Sie können die DRAGEN-Anwendungen anzeigen, die mit dem Lauf verknüpft sind, den % ≥ Q30, die Ausbeute, Reads-PF insgesamt und den Speicherplatz, den der Lauf auf dem Gerät einnimmt. Wenn Sequenzierungsdaten gelöscht oder vom Gerät übertragen werden, zeigt die Speicherplatzmetrik 0 GB an.

Wählen Sie den Lauf, um zusätzliche Ergebnisse des Laufs wie detaillierte Sequenzierung und Sekundäranalyse-Metriken anzuzeigen.

Das Gerät ist für die vorübergehende Speicherung von Sequenzierungslaufdaten ausgelegt. Abgeschlossene Läufe müssen möglicherweise gelöscht werden, um Platz für nachfolgende Läufe zu schaffen.

1. Wählen Sie das Menüsymbol in der oberen linken Ecke.
2. Wählen Sie Runs (Läufe).
3. Wählen Sie für den Lauf, den Sie löschen möchten, das Auslassungszeichen in der Spalte Action (Aktion).
4. Wählen Sie eine der folgenden Optionen.
• Delete run data (Laufdaten löschen) – Löscht die Sequenzierungs- und Analyse-Ausgabeordner, entfernt den Lauf jedoch nicht von der Registerkarte Completed (Abgeschlossen). Sie können die Laufdetails, aber nicht den Bericht der DRAGEN-Sekundäranalyse anzeigen.
• Delete run (Lauf löschen) – Löscht die Laufdaten und entfernt den Lauf von der Registerkarte Completed (Abgeschlossen).
5. Bestätigen Sie im Dialogfeld die Löschung des Laufs.

Die Funktion zur erneuten Aufnahme in die Warteschlange ist nur für Läufe verfügbar, die auf dem Gerät verbleiben. Sobald die Daten vom Gerät gelöscht wurden, können sie nicht erneut in die Warteschlange gestellt werden.

1. Wählen Sie das Menüsymbol in der oberen linken Ecke.
1. Wählen Sie Runs (Läufe).
2. Wählen Sie die Registerkarte Completed (Abgeschlossen).
3. Wählen Sie den Sequenzierungslauf aus, der erneut in die Warteschlange gestellt werden soll.
4. Navigieren Sie zum Abschnitt Sekundäranalyse.
5. Wählen Sie Requeue Analysis (Analyse erneut in die Warteschlange stellen).
6. Konfigurieren Sie die Analyseeinstellungen in der Warteschlange, indem Sie den Anweisungen in der Software folgen.
7. Wählen Sie Requeue Analysis (Analyse erneut in die Warteschlange stellen).