Archivos de resultados del análisis secundario de DRAGEN
En esta sección, se ofrece información sobre cada aplicación DRAGEN, incluida la información del archivo de resultados. Además de generar archivos específicos de cada aplicación, DRAGEN Analysis ofrece métricas del análisis en un archivo <sample_name>.metrics.json y los informes descritos en Informes de análisis secundarios de MiSeq i100 Plus. Para obtener más información sobre DRAGEN, consulte la página del sitio de asistencia del Análisis secundario de DRAGEN.
Todos los procesos de DRAGEN permiten la descompresión de archivos de entrada BCL y la compresión de archivos de salida BAM/CRAM. Los archivos BAM no se cargan en el análisis secundario de DRAGEN si se selecciona Proactive (Proactivo), Run Monitoring (Supervisión del experimento) y Storage (Almacenamiento).
DRAGEN BCL Convert
La aplicación DRAGEN BCL Convert admite las funciones siguientes:
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Descompresión de datos BCL de entrada |
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Demultiplexado de muestras |
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Manipulación de adaptadores y UMI |
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Generación de archivos FASTQ |
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Compresión de archivos FASTQ en formatos ORA o Gzip |
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Generación de métricas de QC FASTQ (solo para las primeras 1024 muestras) |
QC de biblioteca DRAGEN
La aplicación DRAGEN RNA admite las funciones siguientes:
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Cálculos de reequilibrio de biblioteca |
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Criterios de medición de CC |
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Métricas de la biblioteca |
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Generación de métricas de QC FASTQ (solo para las primeras 1024 muestras) |
Genoma completo pequeño DRAGEN
La aplicación DRAGEN Small Whole Germline admite las funciones siguientes:
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Llamadas de variantes pequeñas |
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Generación de métricas de QC FASTQ (solo para las primeras 1024 muestras) |
DRAGEN Microbial Enrichment Plus
La aplicación DRAGEN Microbial Enrichment Plus admite las funciones siguientes:
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Muestra de control de calidad/deshosting |
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Detección y cuantificación de patógenos |
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Secuenciación de aminoácidos viral |
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Análisis de marcadores de resistencia a los antimicrobianos (RAM) |
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Análisis de clados/linajes virales (Nextclade) |
