Cebadores personalizados
Para usar cebadores personalizados para un experimento, es necesario realizar los pasos siguientes durante la configuración del experimento:
• | Prepare y añada el volumen adecuado de cada cebador personalizado a las posiciones de cebador personalizado del cartucho de reactivos. |
• | Durante la revisión del experimento, configure el experimento para usar el cebador personalizado. |
– | Para NovaSeq X Series Control Software v1.2 y anteriores, descargue el archivo XML de fórmula de cebador personalizado adecuado en la página de NovaSeq X Series en el sitio de asistencia de Illumina. Cargue la fórmula de cebador personalizado durante la revisión del experimento. |
– | Para NovaSeq X Series Control Software v1.3 y posteriores, seleccione las casillas de verificación del cebador personalizado correspondientes. Al cargar una fórmula personalizada se desactivan las casillas de verificación del cebador personalizado. |
Todos los demás pasos siguen el flujo de trabajo estándar. Consulte Protocol para obtener instrucciones sobre el protocolo de secuenciación.
Cuando se utilizan cebadores personalizados para la lectura 1 o la lectura 2, el software indica al instrumento que tire de los pocillos CP1 y CP2. Por lo tanto, los cebadores Illumina no se utilizan para el experimento de secuenciación. Los cebadores Illumina se refieren a los cebadores que ya están en el cartucho de reactivos.
Si no se utilizan los cebadores Illumina para la lectura 1 o la lectura 2, el control PhiX de Illumina opcional no se secuencia. Para utilizar el control PhiX con cebadores personalizados, póngase en contacto con el servicio de asistencia técnica de Illumina para obtener orientación.
Dado que PhiX no está indexado, los datos de secuenciación del control PhiX no se generan para las lecturas de índices, independientemente de qué cebador de indexación se utilice.