Secuenciación mediante ciclo de oscuridad
En esta sección se describe el uso de la secuenciación mediante ciclo de oscuridad en la fórmula.
La secuenciación mediante ciclo de oscuridad se utiliza tan solo para completar los pasos del proceso químico de un ciclo de secuenciación. Consulte la página Compatible Products (Productos compatibles) para su kit de preparación de bibliotecas en el Sitio de asistencia de Illumina para saber si se requiere la secuenciación mediante ciclo de oscuridad.
Siga los pasos a continuación para la secuenciación mediante ciclo de oscuridad.
| 1. | Para solicitar la edición del archivo XML de la fórmula adecuado, póngase en contacto con el servicio de asistencia técnica de Illumina. |
| 2. | Edite el archivo XML de la fórmula. |
| a. | Vaya a la sección <ReadDefinitions> del archivo de fórmula y, a continuación, identifique las secciones <ReadDefinition Name="Read 1"> y <ReadDefinition Name="Read 2">. |
| b. | En <ReadDefinition Name="Read 1">, añada el siguiente paso de ciclo de oscuridad en una nueva línea antes de <ImagingRef ImagingName="Cycle1Read1Imaging"/> y después de <ChemistryRef ChemistryName="FirstBase"/>: |
<ChemistryRef ChemistryName="CompleteCycleReuse"/>.
| c. | En <ReadDefinition Name="Read 2">, añada el paso de ciclo de oscuridad en una nueva línea antes de <ImagingRef ImagingName="Cycle1Read4Imaging"/> y después de <ChemistryRef ChemistryName="FirstBase"/>. |
| 3. | Guarde el archivo XML de la fórmula. |
A continuación, se muestra una fórmula de muestra con el paso de ciclo de oscuridad:
...
<ReadDefinitions>
<ReadDefinition Name="Read 1">
<CycleStepCollection Name="Cycle1" Cycles="1">
<ChemistryRef ChemistryName="FirstBase"/>
<ChemistryRef ChemistryName="CompleteCycleReuse"/>
<ImagingRef ImagingName="Cycle1Read1Imaging"/>
</CycleStepCollection>
<CycleStepCollection Name="CompleteCycle" Cycles="read1cycles-1">
<ChemistryRef ChemistryName="CompleteCycleReuse"/>
<ImagingRef ImagingName="CompleteCycleImaging" />
</CycleStepCollection>
</ReadDefinition>
...
<ReadDefinition Name="Read 2">
<CycleStepCollection Name="Cycle1" Cycles="1">
<ChemistryRef ChemistryName="FirstBase"/>
<ChemistryRef ChemistryName="CompleteCycleReuse"/>
<ImagingRef ImagingName="Cycle1Read4Imaging" />
</CycleStepCollection>
<CycleStepCollection Name="CompleteCycle" Cycles="read2cycles-1">
<ChemistryRef ChemistryName="CompleteCycleReuse"/>
<ImagingRef ImagingName="CompleteCycleImaging" />
</CycleStepCollection>
</ReadDefinition>
</ReadDefinitions>
...
