Gestión de experimentos
La pantalla Runs (Experimentos) muestra la lista de experimentos planificados, experimentos activos y experimentos terminados. Cada experimento se identifica con el nombre del experimento. Para buscar un experimento, use el nombre del experimento, el ID de la gradilla de tubos de la biblioteca y la primera aplicación de DRAGEN añadida al experimento. También puede ver la cantidad de almacenamiento de datos del instrumento consumida por todos los experimentos y la cantidad de espacio de almacenamiento aún disponible. Consulte Clear Hard Drive Space para obtener información sobre cómo eliminar experimentos.
En el software de control remoto, puede exportar la hoja de muestras de un experimento. Seleccione el nombre del experimento y, a continuación, seleccione Sample Sheet (Hoja de muestras). Seleccione Save as (Guardar como) para guardar la hoja de muestras.
Experimentos planificados
La pestaña Planned (Planificados) muestra los experimentos planificados de forma local o en la nube. Puede planificar ejecuciones localmente en el instrumento NovaSeq X Series o en un ordenador conectado a la red. Para planificar los experimentos en la nube, utilice BaseSpace Sequence Hub.
Puede editar o eliminar experimentos planificados localmente en la pestaña Planned (Planificados). Para editar un experimento planificado, seleccione el experimento en la pestaña Planned (Planificados). Para eliminar un experimento planificado, seleccione el icono de puntos suspensivos de la columna Actions (Acciones).
La pestaña Planned (Planificados) muestra la información siguiente:
| • | Status (Estado): el estado del experimento de secuenciación. Los experimentos planificados pueden existir en uno de los estados siguientes: |
| – | Planned (Planificado): el experimento está disponible para seleccionarlo para secuenciación. |
| – | Draft (Borrador): el experimento no está disponible para seleccionarlo para secuenciación. |
| – | Needs attention (Necesita atención): el experimento no está disponible debido a un error (p. ej., se ha interrumpido la conexión con la nube). Puede revisar el error en la pantalla Run details (Detalles del experimento). |
| • | Run name (Nombre del experimento): el nombre del experimento. |
| • | Application (Aplicación): las aplicaciones de análisis secundarios de DRAGEN asociadas con el experimento. Para obtener más información sobre la instalación de aplicaciones, consulte Manage DRAGEN Applications. |
| • | Last modified (Última modificación): la fecha y la hora en que el experimento se editó por última vez. |
Experimentos activos
La pestaña Active (Activos) muestra cualquier experimento en curso, incluidos los experimentos planificados y los experimentos creados manualmente. La pestaña Active (Activos) incluye la fecha de comienzo de la secuenciación, el lado del instrumento, el estado de la secuenciación y las métricas de % ≥Q30, el rendimiento y el total de lecturas PF.
En la pestaña Active (Activos), puede cancelar la carga de datos en su ubicación de almacenamiento o cancelar el análisis secundario. Consulte End a Run para obtener más información. La cancelación de un experimento durante la secuenciación no está disponible en la pestaña Active (Activos).
Seleccione el nombre del experimento para desplazarse a la página Run details (Detalles del experimento) y ver detalles adicionales sobre el experimento. Seleccione el menú desplegable junto al experimento para ver detalles adicionales sobre el estado de secuenciación y las aplicaciones de DRAGEN asociadas.
Para obtener más información sobre las métricas y el estado del experimento, consulte Monitor Run Progress.
Experimentos terminados
La pestaña Completed (Terminados) muestra experimentos que han finalizado la secuenciación y el análisis, se cancelaron o no completaron la secuenciación o el análisis. Puede ver la ubicación de los datos de secuenciación y de resultados del análisis, las métricas de secuenciación y la cantidad de almacenamiento de datos del instrumento consumida por el experimento. Puede ver las aplicaciones de DRAGEN asociadas con el experimento, el % ≥Q30, el rendimiento, el total de lecturas PF y el espacio de disco que el experimento ocupa en el instrumento. Cuando los datos de secuenciación se eliminan o se transfieren fuera del instrumento, la métrica de espacio muestra 0 GB.
Para ver resultados de experimentos adicionales, como métricas de la secuenciación detallada y del análisis secundario, seleccione el experimento.
Para eliminar un experimento, seleccione el icono de puntos suspensivos en la columna Action (Acción). Puede eliminar el experimento o eliminar solo los datos de este. La eliminación de los datos del experimento elimina las carpetas de secuenciación y análisis generadas por el experimento, pero conserva los detalles básicos de este y no elimina el experimento de la pestaña Completed (Terminados). Al eliminar el experimento, este se elimina por completo.
