Configuración de un análisis secundario

Los sistemas de secuenciación NovaSeq X y NovaSeq X Plus le permiten realizar múltiples análisis de DRAGEN en un experimento de secuenciación individual. Antes de configurar los análisis secundarios, asegúrese de tener instalada la aplicación de DRAGEN adecuada en el instrumento. Para obtener más información sobre la instalación de aplicaciones de DRAGEN, consulte Install Applications.

Puede crear hasta 12 combinaciones de genoma de referencia y aplicación de análisis con una aplicación solo para BCL Convert adicional. Para cada combinación, puede utilizar hasta 32 configuraciones utilizando un kit de preparación de bibliotecas, un kit de adaptador de índice o ajustes de configuración diferentes para una combinación de genoma de referencia y aplicación de análisis ya utilizada. 

Las combinaciones siguientes se incluyen en el límite de 12 configuraciones:

• La misma aplicación de análisis y versión de aplicación con un genoma de referencia diferente
• El mismo genoma de referencia con una aplicación o versión de aplicación diferentes
• Una aplicación o versión de aplicación diferentes con un genoma de referencia diferente

Configure el análisis secundario tal y como se indica a continuación.

1. Seleccione una aplicación y proporcione los siguientes parámetros de configuración para el experimento:
• [Opcional] Descripción de la configuración
• Kit de preparación de bibliotecas
• Kit de adaptador de índice
• Genoma de referencia (no aplicable para DRAGEN BCL Convert)

Cuando se selecciona un kit de preparación de bibliotecas de Illumina, las secuencias del adaptador para la Lectura 1 y la Lectura 2 se rellenan automáticamente y no se pueden modificar. Los ciclos de anulación también se rellenan de forma automática.

2. Proporcione los ajustes de análisis adicionales necesarios. Los ajustes disponibles o necesarios varían en función de la aplicación, la versión de la aplicación y los parámetros de configuración seleccionados. Para obtener más información sobre el análisis secundario de DRAGEN, consulte la página del sitio de asistencia de DRAGEN Bio-IT Platform de Illumina.
3. Para introducir la información de la muestra, utilice una de las siguientes opciones:
• Para importar la información de la muestra, descargue la plantilla CSV, añada la información de la muestra e importe el archivo CSV editado.
• Pegue los ID de las muestras y las posiciones de pocillos de la placa de índices, o los índices i7 e i5 directamente desde un archivo externo. Antes de pegar, añada filas de muestras adicionales según sea necesario. Los ID de muestra pueden contener un máximo de 20 caracteres alfanuméricos, guiones y guiones bajos.

Las placas de índices con una disposición fija requieren entradas para la posición de los pocillos. Las placas que no tienen una disposición fija requieren entradas para los índices i7 e i5. Los índices i5 deben introducirse en dirección de avance.

• Introduzca manualmente los ID de muestra y las posiciones o los índices de pocillos correspondientes. Si se selecciona Not Specified (No especificado) para el kit de preparación de bibliotecas, introduzca las secuencias del Índice 2 (i5) en dirección de avance.
4. Finalice la configuración del experimento.
• Para editar los detalles del experimento más tarde, seleccione Save as draft (Guardar como borrador).
• Para finalizar los detalles del experimento y hacer que el experimento esté disponible para la secuenciación, seleccione Save as planned (Guardar como planificado).