Ajon hallinta

Runs (Ajot) -näytössä on luettelo suunnitelluista ajoista, aktiivisista ajoista ja suoritetuista ajoista. Jokainen ajo tunnistetaan ajon nimestä. Voit hakea ajoa käyttämällä ajon nimeä ja ajoon lisättyä DRAGEN-sovellusta. Voit myös tarkastella kaikkien ajojen käyttämää laitetietojen tallennustilaa ja vielä käytettävissä olevaa tallennustilaa.

Illumina Run Managerissa voit viedä ajon näytearkin. Valitse ajon nimi ja valitse sitten Sample Sheet (Näytearkki). Tallenna näytearkki valitsemalla Save as (Tallenna nimellä).

Planned (Suunnitellut) -välilehdessä näkyvät paikallisesti tai pilviympäristössä suunnitellut ajot. Voit suunnitella ajoja paikallisesti MiSeq i100 Plus -laitteella Illumina Run Managerin kautta. Suunnittele ajoja pilvessä BaseSpace Sequence Hubilla.

Voit muokata tai poistaa paikallisesti suunniteltuja ajoja Planned (Suunnitellut) -välilehdessä. Jos haluat muokata suunniteltua ajoa, valitse kyseinen ajo Planned (Suunnitellut) -välilehdessä. Poista suunniteltu ajo valitsemalla ellipsikuvake Actions (Toimenpiteet) -sarakkeesta.

Planned (Suunnitellut) -välilehti sisältää seuraavat tiedot:

• Status (Tila) – sekvensointiajon tila. Suunnitellut ajot voivat olla jossakin seuraavista tiloista:
– Planned (Suunniteltu) – Ajo on valittavissa sekvensointia varten.
– Draft (Luonnos) – Ajo ei ole valittavissa sekvensointia varten.
– Needs attention (Vaatii huomiota) – Ajo ei ole käytettävissä virheen vuoksi (esim. pilviyhteydessä on häiriö). Voit tarkastella virhettä Run details (Ajon tiedot) -näytössä.
• Run name (Ajon nimi) – Kyseisen ajon nimi.
• Application (Sovellus) – Ajoon liittyvä DRAGEN-sovelluksen toissijainen analyysi. Lisätietoja sovellusten asentamisesta on kohdassa Sovellukset.
• Last modified (Viimeksi muokattu) – Ajon viimeisin muokkauspäivä ja -aika.

Active (Aktiivinen) -välilehdessä näkyvät kaikki käynnissä olevat ajot. Active (Aktiivinen) -välilehti sisältää sekvensoinnin aloituspäivämäärän, sekvensoinnin tilan sekä % ≥ Q30:n, saannon ja kokonaisreadien PF-mittarit.

Valitse ajon nimi siirtyäksesi Run details (Ajon tiedot) -sivulle ja tarkastellaksesi ajon lisätietoja. Valitse ajon viereinen pudotusvalikko, jos haluat tarkastella sekvensoinnin tilaa ja siihen liittyviä DRAGEN-sovelluksia koskevia lisätietoja.

Lisätietoja ajon mittareista ja tilasta on kohdassa Ajon edistymisen seuraaminen.

Completed (Valmis) -välilehdessä näkyvät ajot, jotka ovat suorittaneet sekvensoinnin ja analyysin, jotka on peruutettu tai jotka eivät ole suorittaneet sekvensointia tai analyysiä. Voit nähdä sekvensointi- ja analyysituotostietojen sijainnin, sekvensointimittarit ja ajon käyttämän laitetietojen tallennustilan. Voit tarkastella suorituserään liittyviä DRAGEN-sovelluksia, % ≥ Q30:tä, saantoa, kokonaisreadien PF:iä ja levytilaa, jota suorituserä vie laitteella. Kun sekvensointitiedot poistetaan tai siirretään pois laitteelta, tilan mittari näyttää 0 Gt.

Jos haluat tarkastella muita ajotuloksia, kuten yksityiskohtaista sekvensointia ja toissijaisia analyysimittareita, valitse kyseinen ajo.

Laite on suunniteltu tallentamaan sekvensointiajon tiedot väliaikaisesti, ja suoritetut ajot on ehkäpä poistettava, jotta voidaan luoda tilaa seuraaville ajoille.

1. Valitse valikkokuvake vasemmasta yläkulmasta.
2. Valitse Runs (Ajot).
3. Valitse poistettavan ajon Action (Toimenpide) -sarakkeesta ellipsikuvake.
4. Valitse yksi seuraavista vaihtoehdoista.
• Delete run data (Poista ajotiedot) – Poistaa sekvensointi- ja analyysituloskansiot, mutta ei poista ajoa Completed (Valmis) -välilehdeltä. Voit tarkastella ajon tietoja, mutta et voi tarkastella DRAGEN-ohjelmiston toissijaisen analyysin raporttia.
• Delete run (Poista ajo) – Poistaa ajotiedot ja poistaa ajon Completed (Valmiit) -välilehdestä.
5. Vahvista ajon poisto valintaikkunassa.

Uudelleenjonotustoiminto on käytettävissä vain laitteessa jäljellä oleville ajoille. Kun tiedot on poistettu laitteesta, sitä ei voi laittaa jonoon uudelleen.

1. Valitse valikkokuvake vasemmasta yläkulmasta.
1. Valitse Runs (Ajot).
2. Valitse Completed (Valmis) -välilehti.
3. Valitse uudelleen jonoon asetettava sekvensointiajo.
4. Siirry Secondary analysis (Toissijainen analyysi) -osioon.
5. Valitse Requeue Analysis (Aseta analyysi uudelleen jonoon).
6. Määritä uudelleen jonoon asetetun analyysin asetukset noudattamalla ohjelmiston kehotteita.
7. Valitse Requeue Analysis (Aseta analyysi uudelleen jonoon).