Mukautetut alukkeet

Mukautettujen alukkeiden käyttö ajossa edellyttää seuraavia lisävaiheita ajon asetusvaiheen aikana:

•

Valmistele ja lisää sopiva määrä kutakin mukautettua aluketta reagenssikasetin mukautettuihin alukepaikkoihin.

•

Määritä ajon tarkastelun aikana ajo mukautetun alukkeen käytölle.

–

NovaSeq X Series Control Software -versiossa 1.2 ja sitä vanhemmissa versioissa lataa asianmukaisen mukautetun alukereseptin XML-tiedosto NovaSeq X Series -sivulta Illumina-tukisivustolla. Lataa mukautettu alukeresepti ajon tarkastelun aikana.

–

Valitse NovaSeq X Series Control Software -versiossa 1.3 ja sitä uudemmissa versioissa soveltuvat mukautettujen alukkeiden ruudut. Mukautetun reseptin lataaminen poistaa mukautetun alukkeen valintaruudut käytöstä.

Kaikki muut vaiheet noudattavat vakiotyönkulkua. Katso sekvensointiprotokollan ohjeet kohdasta Protokolla.

Kun mukautettuja alukkeita käytetään Read 1:lle tai Read 2:lle, ohjelmisto ohjaa laitteen vetämään CP1- ja CP2-kuopista. Siksi Illumina-alukkeita ei käytetä sekvensointiajossa. Illumina-alukkeilla viitataan jo reagenssikasetissa oleviin alukkeisiin.

Jos Illumina-alukkeita ei käytetä Read 1:tä Read 2:ta varten, valinnaista Illumina PhiX -kontrollia ei sekvensoida. Jos haluat käyttää PhiX-kontrollia mukautettujen alukkeiden kanssa, ota yhteyttä Illumina-yhtiön tekniseen tukeen saadaksesi opastusta.