Ajon hallinta

Runs (Ajot) -näytössä on luettelo suunnitelluista ajoista, aktiivisista ajoista ja suoritetuista ajoista. Jokainen ajo tunnistetaan ajon nimestä. Voit hakea ajoa käyttämällä ajon nimeä, kirjastoputkirivin tunnusta ja ensimmäistä ajoon lisättyä DRAGEN-sovellusta. Voit myös tarkastella kaikkien ajojen käyttämää laitetietojen tallennustilaa ja vielä käytettävissä olevaa tallennustilaa. Lisätietoja ajojen poistamisesta on kohdassa Kiintolevyaseman levytilan tyhjentäminen.

Ohjausohjelmisto-etäsovelluksessa voit viedä ajon näytearkin. Valitse ajon nimi ja valitse sitten Sample Sheet (Näytearkki). Tallenna näytearkki valitsemalla Save as (Tallenna nimellä).

Planned (Suunnitellut) -välilehdessä näkyvät paikallisesti tai pilviympäristössä suunnitellut ajot. Voit suunnitella ajosi paikallisesti käyttämällä NovaSeq X Series -ohjelmistoa laitteessa tai verkkoon liitetyn tietokoneen kautta. Käytä BaseSpace Sequence Hub -ohjelmistoa, kun haluat suunnitella ajoja pilviympäristössä.

Voit muokata tai poistaa paikallisesti suunniteltuja ajoja Planned (Suunnitellut) -välilehdessä. Jos haluat muokata suunniteltua ajoa, valitse kyseinen ajo Planned (Suunnitellut) -välilehdessä. Poista suunniteltu ajo valitsemalla roskakorikuvake Actions (Toimenpiteet) -sarakkeesta.

Planned (Suunnitellut) -välilehti sisältää seuraavat tiedot:

• Status (Tila) – sekvensointiajon tila. Suunnitellut ajot voivat olla jossakin seuraavista tiloista:
– Planned (Suunniteltu) – Ajo on valittavissa sekvensointia varten.
– Draft (Luonnos) – Ajo ei ole valittavissa sekvensointia varten.
– Needs attention (Vaatii huomiota) – Ajo ei ole käytettävissä virheen vuoksi (esim. pilviyhteydessä on häiriö). Voit tarkastella virhettä Run details (Ajon tiedot) -näytössä.
• Run name (Ajon nimi) – Kyseisen ajon nimi.
• Application (Sovellus) – Ajoon liittyvä DRAGEN-sovelluksen toissijainen analyysi. Lisätietoja sovellusten asentamisesta on kohdassa DRAGEN-sovellusten hallinta.
• Last modified (Viimeksi muokattu) – Ajon viimeisin muokkauspäivä ja -aika.

Active (Aktiivinen) -välilehdessä näkyvät kaikki käynnissä olevat ajot, mukaan lukien suunnitellut ajot ja manuaalisesti luodut ajot. Active (Aktiivinen) -välilehti sisältää sekvensoinnin aloituspäivämäärän, laitteen puolen, sekvensoinnin tilan sekä % ≥ Q30:n, saannon ja kokonaisreadien PF-mittarit.

Active (Aktiivinen) -välilehdessä voit peruuttaa tietojen lataamisen tallennussijaintiisi tai toissijaisen analyysin. Katso lisätietoja kohdasta Ajon päättäminen. Ajon peruuttaminen sekvensoinnin aikana ei ole käytettävissä Active (Aktiivinen) -välilehdessä.

Valitse ajon nimi siirtyäksesi Run details (Ajon tiedot) -sivulle ja tarkastellaksesi ajon lisätietoja. Valitse ajon viereinen pudotusvalikko, jos haluat tarkastella sekvensoinnin tilaa ja siihen liittyviä DRAGEN-sovelluksia koskevia lisätietoja.

Lisätietoja ajon mittareista ja tilasta on kohdassa Ajon edistymisen seuraaminen.

Completed (Valmis) -välilehdessä näkyvät ajot, jotka ovat suorittaneet sekvensoinnin ja analyysin, jotka on peruutettu tai jotka eivät ole suorittaneet sekvensointia tai analyysiä. Voit nähdä sekvensointi- ja analyysituotostietojen sijainnin, sekvensointimittarit ja ajon käyttämän laitetietojen tallennustilan. Voit tarkastella ajoon liittyviä DRAGEN-sovelluksia, % ≥ Q30:tä, saantoa, kokonaisreadien PF:iä ja levytilaa, jota ajo vie laitteella. Kun sekvensointitiedot poistetaan tai siirretään pois laitteelta, tilan mittari näyttää 0 Gt.

Jos haluat tarkastella muita ajotuloksia, kuten yksityiskohtaista sekvensointia ja toissijaisia analyysimittareita, valitse kyseinen ajo.

Poista ajo valitsemalla ellipsikuvake Action (Toimenpide) -sarakkeesta. Voit poistaa ajon tai vain ajotiedot. Ajotietojen poistaminen poistaa ajon luomat sekvensointi- ja analyysikansiot, mutta säilyttää ajon perustiedot eikä poista ajoa Completed (Valmis) -välilehdeltä. Ajon poistaminen poistaa sen kokonaan.