Ajon hallinta

Runs (Ajot) -näytössä on luettelo suunnitelluista ajoista, aktiivisista ajoista ja suoritetuista ajoista. Jokainen ajo tunnistetaan ajon nimestä. Voit hakea ajoa käyttämällä ajon nimeä, kirjastoputkirivin tunnusta ja ensimmäistä ajoon lisättyä DRAGEN-sovellusta. Voit myös tarkastella kaikkien ajojen käyttämää laitetietojen tallennustilaa ja vielä käytettävissä olevaa tallennustilaa. Lisätietoja ajojen poistamisesta on kohdassa Kiintolevyaseman levytilan tyhjentäminen.

Ohjausohjelmiston etäsovelluksessa voit viedä ajon näytearkin. Valitse ajon nimi ja valitse sitten Sample Sheet (Näytearkki). Tallenna näytearkki valitsemalla Save as (Tallenna nimellä).

Planned (Suunnitellut) -välilehdessä näkyvät paikallisesti tai pilviympäristössä suunnitellut ajot. Voit suunnitella ajot paikallisesti käyttämällä NovaSeq X Series -ohjelmistoa laitteessa tai verkkoon liitetyn tietokoneen kautta. Suunnittele ajoja pilvessä BaseSpace Sequence Hubilla.

Voit muokata tai poistaa paikallisesti suunniteltuja ajoja Planned (Suunnitellut) -välilehdessä. Jos haluat muokata suunniteltua ajoa, valitse kyseinen ajo Planned (Suunnitellut) -välilehdessä. Poista suunniteltu ajo valitsemalla ellipsikuvake Actions (Toimenpiteet) -sarakkeesta.

Planned (Suunnitellut) -välilehti sisältää seuraavat tiedot:

• Status (Tila) – sekvensointiajon tila. Suunnitellut ajot voivat olla jossakin seuraavista tiloista:
– Planned (Suunniteltu) – Ajo on valittavissa sekvensointia varten.
– Draft (Luonnos) – Ajo ei ole valittavissa sekvensointia varten.
– Needs attention (Vaatii huomiota) – Ajo ei ole käytettävissä virheen vuoksi (esim. pilviyhteydessä on häiriö). Voit tarkastella virhettä Run details (Ajon tiedot) -näytössä.
• Run name (Ajon nimi) – Kyseisen ajon nimi.
• Application (Sovellus) – Ajoon liittyvä DRAGEN-sovelluksen toissijainen analyysi. Lisätietoja sovellusten asentamisesta on kohdassa Hallinnoi DRAGEN-sovelluksia.
• Last modified (Viimeksi muokattu) – Ajon viimeisin muokkauspäivä ja -aika.

Active (Aktiivinen) -välilehdessä näkyvät kaikki käynnissä olevat ajot, mukaan lukien suunnitellut ajot ja manuaalisesti luodut ajot. Active (Aktiivinen) -välilehti sisältää sekvensoinnin aloituspäivämäärän, laitteen puolen, sekvensoinnin tilan sekä %≥ Q30:n, saannon ja kokonaisreadien PF-mittarit.

Active (Aktiivinen) -välilehdessä voit peruuttaa tietojen lataamisen tallennussijaintiisi tai toissijaisen analyysin. Katso lisätietoja kohdasta Ajon päättäminen. Ajon peruuttaminen sekvensoinnin aikana ei ole käytettävissä Active (Aktiivinen) -välilehdessä.

Valitse ajon nimi siirtyäksesi Run details (Ajon tiedot) -sivulle ja tarkastellaksesi ajon lisätietoja. Valitse ajon viereinen pudotusvalikko, jos haluat tarkastella sekvensoinnin tilaa ja siihen liittyviä DRAGEN-sovelluksia koskevia lisätietoja.

Lisätietoja ajon mittareista ja tilasta on kohdassa Ajon edistymisen seuraaminen.

Completed (Valmis) -välilehdessä näkyvät ajot, jotka ovat suorittaneet sekvensoinnin ja analyysin, jotka on peruutettu tai jotka eivät ole suorittaneet sekvensointia tai analyysiä. Voit nähdä sekvensointi- ja analyysituotostietojen sijainnin, sekvensointimittarit ja ajon käyttämän laitetietojen tallennustilan. Voit tarkastella ajoon liittyviä DRAGEN-sovelluksia, % ≥ Q30:tä, saantoa, kokonaisreadien PF:iä ja levytilaa, jota ajo vie laitteella. Kun sekvensointitiedot poistetaan tai siirretään pois laitteelta, tilan mittari näyttää 0 Gt.

Jos haluat tarkastella muita ajotuloksia, kuten yksityiskohtaista sekvensointia ja toissijaisia analyysimittareita, valitse kyseinen ajo.

Poista ajo valitsemalla ellipsikuvake Action (Toimenpide) -sarakkeesta. Voit poistaa ajon tai vain ajotiedot. Ajotietojen poistaminen poistaa ajon luomat sekvensointi- ja analyysikansiot, mutta säilyttää ajon perustiedot eikä poista ajoa Completed (Valmis) -välilehdeltä. Ajon poistaminen poistaa sen kokonaan.