Logiciel intégré

La suite logicielle du système MiSeq i100 Plus comporte des applications intégrées qui effectuent les séries et l’analyse du séquençage.

• Logiciel de contrôle MiSeq i100 Plus : contrôle les opérations de l’instrument et fournit une interface pour configurer le système, configurer une série de séquençage et surveiller les statistiques de série à mesure que le séquençage progresse et afficher les données DRAGEN.
• Real-Time Analysis (RTA) : effectue une analyse d’image et une définition de base lors de la série. Pour en savoir plus, consultez la section Real-Time Analysis.
• Universal Copy Service (UCS) : ce logiciel copie les fichiers de sortie dans le dossier de sortie tout au long de l’analyse. Le cas échéant, le service transfère également les données vers BaseSpace Sequence Hub ou Illumina Connected Analytics (ICA).
• Analyse secondaire DRAGEN : effectue une analyse secondaire accélérée du matériel pour un menu sélectionné d’applications.
• Illumina Run Manager : permet l’accès à distance au logiciel de contrôle MiSeq i100 Plus pour la planification, la surveillance et l’examen des résultats de la série. Les utilisateurs disposant d’un accès administrateur peuvent également gérer certains paramètres d’instrument et de compte.

Le logiciel de contrôle MiSeq i100 Plus est interactif et exécute des processus d’arrière-plan automatisés. Real-Time Analysis et UCS exécutent leurs processus en arrière-plan uniquement.

Informations système

Dans le logiciel de contrôle MiSeq i100 Plus, sélectionnez l’icône de menu dans le coin supérieur gauche pour ouvrir le menu de navigation globale. Sélectionnez l’icône Settings (Paramètres), puis About (À propos de) pour afficher les coordonnées Illumina et les informations système suivantes :

• Version du logiciel de contrôle MiSeq i100 Plus
• Nom de l’ordinateur
• Version de l’image du système d’exploitation
• Numéro d’analyse de l’instrument
• Nombre total de cycles

Importation et exportation de fichiers

• Vous pouvez accéder aux fichiers d’entrée se trouvant sur l’emplacement de stockage externe configuré via le navigateur de fichiers du logiciel MiSeq i100 Plus Control.
• Les fichiers d’entrée sont également accessibles via le logiciel MiSeq i100 Plus Control à distance sur un ordinateur en réseau à l’aide du navigateur de fichiers du système d’exploitation local. Veuillez consulter la section Illumina Run Manager.
• Les fichiers de sortie de série et les journaux d’exportation se trouvent sur le stockage externe en fonction des paramètres de stockage externes. Veuillez consulter la section Définir le dossier de sortie par défaut.

Notifications et alertes

Pour afficher toutes les notifications système, sélectionnez l’icône en forme de cloche dans le coin supérieur droit, puis sélectionnez Notifications. L’écran Notifications contient les onglets suivants :

• Notifications : affiche une liste des notifications actuelles.
• Historique : affiche les erreurs et avertissements historiques.

Lorsqu’une erreur ou un avertissement se produit, le logiciel de contrôle MiSeq i100 Plus affiche une alerte pendant l’action.

• Les erreurs critiques du système nécessitent une attention immédiate pour arrêter l’instrument et contacter l’assistance technique Illumina pour obtenir de l’aide.
• Les erreurs système non critiques nécessitent une action avant de démarrer ou de poursuivre la série. Selon l’erreur, le logiciel de contrôle MiSeq i100 Plus propose l’action appropriée pour résoudre l’erreur.
• Les avertissements ne nécessitent pas d’action avant de commencer ou de poursuivre la série. Lorsqu’un avertissement se produit, le logiciel de contrôle MiSeq i100 Plus propose l’action appropriée pour résoudre l’avertissement.
• Les notifications fournissent des informations concernant les événements qui ne sont pas liés à l’action en cours. Le nombre de notifications actuelles est affiché sur l’icône Notifications dans le menu de navigation globale. Rejeter les notifications ou résoudre la notification dans l’onglet Notifications.