Considérations relatives au réseau

Le NextSeq 1000/2000 Sequencing System est conçu pour être utilisé avec un réseau. L’ordinateur de contrôle NextSeq 1000/2000 exécute CentOS avec SELinux activé. Le NextSeq 1000/2000 ne prend pas en charge le chiffrement activé.

L’exécution d’une série en mode manuel nécessite une connexion réseau pour transférer les données de la série vers un emplacement de stockage réseau. Illumina recommande d’enregistrer les données de fonctionnement sur un lecteur externe ou réseau. Le disque dur local sur le NextSeq 1000/2000 Sequencing System est destiné au stockage temporaire avant le transfert automatique des données.

Une connexion Internet est requise pour les opérations suivantes :

• Télécharger les données de performance de l’instrument pour l’assistance Illumina Proactive (reportez-vous à la Note technique Proactive Illumina (document n° 1000000052503).
• [Facultatif] Obtenir de l’assistance à distance du support technique Illumina.

Sécurité et réseautage

Il est recommandé d’examiner les meilleures pratiques de sécurité Illumina sur le site Sécurité informatique et réseaux du contrôle des instruments Illumina (document n° 1000000085920) pour assurer la sécurité de votre instrument. Ces meilleures pratiques comprennent, par exemple, l’activation de pare-feu et l’utilisation de paramètres de compte appropriés.

Utilisez les recommandations suivantes pour installer et configurer une connexion réseau :

• Utilisez une connexion de 1 gigaoctet dédiée entre l’instrument et votre système de gestion des données locales. Cette connexion peut être établie directement ou à l’aide d’un commutateur réseau géré.
• La bande passante requise pour une connexion est la suivante :
– Bande passante intranet de 200 Mo/s/instrument pour le stockage local.
– Bande passante Internet minimale de 5 Mo/s/instrument pour prendre en charge le téléchargement des flux de travail NextSeq 1000/2000 Control Software et DRAGEN (~15 Go). Le téléchargement expire au bout de 6 heures. Une bande passante Internet de 35 Mo/s/instrument est nécessaire pour prendre en charge le téléchargement dans l’heure.
– Bande passante Internet de 10 Mo/s/instrument pour le stockage dans le cloud BaseSpace Sequence Hub (y compris l’assistance Illumina Proactive).
– Bande passante Internet de 5 Mo/s pour la surveillance de d série ou l’assistance Illumina Proactive uniquement.
• Les commutateurs doivent être gérés.
• L’équipement de réseau comme les commutateurs doit avoir un débit minimum de 1 gigaoctet par seconde.
• Calculez la capacité totale de la charge de travail sur chaque commutateur réseau. Le nombre d’instruments connectés et d’équipements auxiliaires, tels qu’une imprimante, peut avoir un impact sur la capacité.
• Si possible, isolez le trafic de séquençage du reste du trafic sur le réseau.
• Illumina recommande l’utilisation de câbles CAT-6 (catégories CAT-5e au minimum). Assurez-vous que les câbles requis sont disponibles avant de commencer l’installation.

Illumina ne propose ni installation ni support technique en ce qui concerne les connexions réseau.

Examiner l’architecture réseau pour les risques de compatibilité potentiels avec le système Illumina, y compris les facteurs suivants :

• Conflits d’adresses IP potentiels : le NextSeq 1000/2000 Sequencing System attribue des adresses IP internes aléatoires dans la plage 169.254.0.0/16, ce qui peut provoquer une défaillance du système en cas de conflits. NextSeq 1000/2000 Control Software v1.2.0 et versions ultérieures comprend une interface réseau virtuelle nommée Docker avec l’adresse IP par défaut 172.17.0.1/16.
• Affectation IP : le NextSeq 1000/2000 Sequencing System prend en charge l’affectation DHCPou IP statique.

Les tableaux suivants décrivent les ports réseau et les domaines de l’ordinateur de contrôle. Utilisez ces tableaux comme référence lors de la configuration de votre réseau.

Connexion

Valeur

Utilisation

Désignation du système d’exploitation

enp5s0

Communication entre les composants internes (ne pas configurer ni modifier après l’installation.)

Domaine

localhost:*

Tous les ports pour la communication localhost à localhost, qui sont nécessaires pour la communication interprocessus.

Port

8081

Real‑Time Analysis

8080

NextSeq 1000/2000 Control Software

29644

Universal Copy Service (UCS)

Connexion

Valeur

Utilisation

Désignation du système d’exploitation

enp6s0

Port Ethernet préféré pour Internet (port droit vu de l’arrière de l’instrument)

enp2s0

Port Ethernet préféré pour la deuxième connexion réseau en option, comme le NAS ou un autre stockage réseau (port gauche vu de l’arrière de l’instrument)

Port

443

BaseSpace Sequence Hub ou configuration proactive Illumina

Pour les domaines de plateforme régionale qui fournissent un accès d’Universal Copy Service à (BaseSpace Sequence Hub) et Illumina Proactive, reportez-vous à la section Contrôle de la sécurité informatique et de la mise en réseau Illumina.