Requérir l’analyse secondaire

Pendant l’analyse secondaire, vous pouvez mettre la série en file d’attente pour effectuer à nouveau l’analyse DRAGEN sur l’instrument. Vous ne pouvez pas faire la file d’attente s’il y a une série de séquençage en cours ou si les données de la série ont été supprimées de l’instrument. Pour plus d’informations sur comment remettre l’analyse secondaire en file d’attente pour une série prévue dans BaseSpace Sequence Hub, reportez‑vous à la page d’assistance BaseSpace Sequence Hub.

1. Sélectionnez l’icône de l’instrument pour ouvrir le menu de navigation global.
2. Sélectionnez Runs (Séries), puis accédez à l’onglet Completed (Terminées).
3. Sélectionnez la série à remettre en file d’attente.
4. Sous Analyse secondaire, sélectionnez Requeue analysis (Remettre l’analyse en file d’attente).
5. Si la remise de l’analyse en file d’attente est destinée à une série locale, sélectionnez l’une des options de file d’attente suivantes :
• Requeue analysis from this run (Remettre l’analyse en file d’attente à partir de cette série) : effectuez une remise en file d’attente à l’aide des fichiers générés dans la série sélectionnée. Vous pouvez sélectionner un dossier vers lequel sortir les fichiers d’analyse en file d’attente.
• Requeue analysis from a sample sheet (Remettre l’analyse en file d’attente à partir d’une feuille d’échantillon) : effectuez une nouvelle file d’attente à l’aide d’une feuille d’échantillon. La file d’attente utilise les configurations d’analyse spécifiées dans la feuille d’échantillon.

Pour remettre une série locale en file d’attente avec 12 cycles d’index, vous devez mettre en file d’attente l’analyse à partir d’une feuille d’échantillon.

6. Si l’analyse en file d’attente est pour une série manuelle, sélectionnez Requeue analysis from sample sheet (Remettre l’analyse en file d’attente dans la feuille d’échantillon).
7. [Facultatif] Cochez la case Skip sample sheet validation (Ignorer la validation de la feuille d’échantillon).

Pour ignorer la validation, la feuille d’échantillon doit être correctement formatée.

8. Saisissez un chemin de fichier de données de séquençage.

Ce chemin détermine l’emplacement de stockage externe pour la série de file d’attente.

9. Saisissez une description pour la file d’attente dans le champ Reason (raison).
10. Sélectionnez Requeue analysis (Remettre l’analyse en file d’attente) lorsque vous avez terminé.
11. Effectuez l’une des actions suivantes. :
• Pour exclure une configuration de la file d’attente, sélectionnez Delete (Supprimer) à côté du nom de la configuration.
• Pour modifier les informations de configuration, sélectionnez Edit (Modifier) à côté du nom de la configuration.
• Pour inclure des configurations supplémentaires, sélectionnez Add configuration (Ajouter une configuration).
12. Sélectionnez Requeue analysis (Remettre l’analyse en file d’attente) lorsque vous avez terminé.