Surveiller la progression de la série
L’écran Sequencing (Séquençage) permet de suivre la progression de la série, d’annuler une série ou d’en lancer une nouvelle. Vous pouvez surveiller la progression de la série sur l’instrument ou à l’aide d’un ordinateur en réseau. Si le suivi des séries dans le cloud est activé, vous pouvez visualiser la progression de la série dans BaseSpace Sequence Hub. Pour afficher d’autres détails et l’état d’une série, consultez la section Run Management.
Pour afficher des indicateurs et des visualisations supplémentaires, vous pouvez utiliser le Sequencing Analysis Viewer (SAV, visionneuse d’analyse de séquençage). Pour en savoir plus sur SAV, consultez la page du site d’assistance Sequencing Analysis Viewer (Visionneuse d’analyse de séquençage).
Si la série est annulée à tout moment, un lavage post-série est effectué automatiquement. Si un lavage post-série échoue ou n’est pas effectué en raison d’une erreur, effectuez un lavage de maintenance avant de commencer une nouvelle série de séquençage. Consultez la section Perform a Maintenance Wash pour obtenir des instructions.
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1.
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Surveillez l’état de la série sur l’écran Sequencing (Séquençage) ou sur l’onglet Active (Actif) de l’écran Runs (Séries). |
L’écran Sequencing (Séquençage) contient le temps de fin de série estimé, qui nécessite 10 séries précédentes pour calculer le temps de fin de série précis.
L’onglet Active (Actif) sur l’écran Runs (Séries) comprend l’heure à laquelle le processus a été démarré et des informations supplémentaires sur l’état de la série. Le statut indique lesquelles des activités suivantes sont en cours :
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Transfert de données de séquençage vers un stockage externe |
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Transfert de fichiers externe |
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Transfert des données d’analyse secondaire vers un stockage externe |
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2.
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Surveillez les paramètres suivants sur l’écran Sequencing (Séquençage) ou Runs (Analyses). |
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% ≥ Q30 : le pourcentage moyen de définition de base avec un score de qualité ≥ 30. |
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Yield (Rendement) : le nombre prévu de bases définies pour la série. |
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Total Reads PF (Total des lectures PF) : le nombre de lectures à lectures appariées (le cas échéant) passant le filtre (en millions). |
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3.
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Pour revoir les détails supplémentaires de la série, sélectionnez le nom de la série sur l’écran Sequencing (Séquençage) ou l’onglet Active (Actif) sur l’écran Runs (Séries). |
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4.
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Une fois la série terminée, vous pouvez consulter d’autres résultats de série en sélectionnant le nom de la série sur l’écran Sequencing (Séquençage) ou l’onglet Completed (Terminé) sur l’écran Runs (Séries). |
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5.
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Laissez les consommables dans l’instrument. Ne les retirez pas avant d’y être invité lors de la prochaine configuration de la série. |
