קובצי פלט של ריצוף

סוג קובץ

תיאור, מיקום ושם הקובץ

קובצי קישור בין בסיסים משורשרים

כל אחד מהאשכולות המנותחים נכלל בקובץ קישור בין בסיסים משורשר, אשר צבור בקובץ אחד לכל מחזור, מסלול ומשטח. הקובץ הצבור כולל את קובצי הקישור בין הבסיסים ששורשרו ואת ציון האיכות המקודד של כל אשכול. קובצי הקישור בין הבסיסים המשורשרים נמצאים בשימוש ב-BaseSpace Sequence Hub או ב-bcl2fastq2.

Data/Intensities/BaseCalls/L001/C1.1

L[lane]_[surface].cbcl, לדוגמה L001_1.cbcl

קובצי מיקום של אשכולות

עבור כל תא זרימה, קובץ מיקום אשכולות בינארי כולל את קואורדינטות ה-XY של האשכולות באריח. פריסה בצורת יהלום או משושה אשר תואמת לפריסת הננו-פתח של תא הזרימה מגדירה מראש את הקואורדינטות.

Data/Intensities

s_[lane].locs

קובצי סינון

קובץ המסנן מציין אם אשכול מסוים עבר דרך מסננים. קובצי הסינון נוצרים במחזור 26 באמצעות 25 מחזורי נתונים. לכל אריח נוצר קובץ סינון אחד.

Data/Intensities/BaseCalls/L001

s_[lane]_[tile].filter

קובצי InterOp

ניתן להציג קובצי דיווח בינאריים במכשיר באמצעות תוכנת הבקרה של המכשיר, או מחוץ למכשיר ב-SAV או BaseSpace Sequence Hub. קובצי ה-InterOp מתעדכנים במהלך ההפעלה.

תיקיית InterOp

קובץ פרטי הפעלה

מפרט את שם ההפעלה, מספר המחזורים בכל קריאה, אם לקריאה יש קריאת אינדקס ומה מספר הענפים והאריחים בתא הזרימה. קובץ פרטי ההפעלה נוצר בתחילת ההפעלה.

[Root folder]‏, RunInfo.xml