כימיה של XLEAP-SBS עיון מהיר
סעיף זה מספק סקירה של הדרכים שבהן השימוש בכימיה של XLEAP-SBS משפיע על האופן שבו משתמשים מתקשרים עם מערכת הריצוף NextSeq 1000/2000. כדי להשתמש בכימיה של XLEAP-SBS, קיימות דרישות תאימות ושינויים בהליכים שיש לפעול לפיהם. דרישות התאימות והשינויים הפרוצדורליים האלה מפורטות כאן. לפרטים נוספים, עיין בפרוטוקול ריצוף ל-XLEAP-SBS.
עדכוני התוכנה הבאים ניתנים להתקנה על-ידי הלקוח. לקבלת הוראות התקנה הן עבור התקנות מקוונות ולא מקוונות, עיין בהערות למהדורה ללקוח של תוכנת הבקרה של NextSeq 1000/2000גרסה 1.7 באתר התמיכה של Illumina.
דרישות תאימות
תוכנה
|
•
|
תוכנת בקרה NextSeq 1000/2000 גרסה 1.7 ומעלה. תוכנת ההתקנה והוראות ההתקנה נמצאות בעמוד Software Downloads (הורדות תוכנה) של אתר התמיכה של Illumina. |
|
•
|
DRAGEN גרסה 4.2 ומעלה. תוכנת ההתקנה והוראות ההתקנה נמצאות בעמוד Software Downloads (הורדות תוכנה) של אתר התמיכה של Illumina. |
תוכנת הבקרה NextSeq 1000/2000 גרסה 1.7 תואמת רק ל-גרסת DRAGEN 4.2. התקן את שני עדכוני התוכנה בו בזמן. לאחר התקנתם, לא ניתן להחזיר עדכוני התוכנה האלה.
גנום ייחוס
|
•
|
גנום ייחוס גרסה 9 ל-DRAGEN גרסה 4.2. הורד את העמוד Product Files (קובצי מוצר) מאתר התמיכה של Illumina. |
שינויי נהלים
|
•
|
ריכוזי ההעמסה ומספרי המחזורים השתנו. עיין בשיקולי ריצוף ל-XLEAP-SBS. |
|
•
|
זמני ההפשרה הנדרשים לחומרים מתכלים XLEAP-SBS הם שונים. עיין בהפשרת חומרים מתכלים XLEAP-SBS. |
|
•
|
נוהלי דנטורציה ודילול במכשיר השתנו. עיין במחולל פרוטוקול דנטורציה ודילול. |
|
•
|
הכנת המחסנית כוללת כעת צעד להפחתת בועות האוויר ולייצוב רכיבי המחסנית, וההיפוך נעשה באיטיות. עיין בהכנת המחסנית. |
|
•
|
השילוב בקבוצות של ערכי Q-table עודכן כדי לשקף את איכות הריצוף המשופרת ואת הדיוק של הכימיה של XLEAP-SBS. עיין בזרימת עבודה של Real-Time Analysis. |
|
•
|
פריימר מותאם אישית חדש עבור XLEAP-SBS. עיין ב-פריימרים מותאמים אישית. |
|
•
|
מתכונים חדשים למחזור כהה עבור XLEAP-SBS. עיין בריצוף במחזור כהה. |
