צור הפעלה מתוכננת
כדי לתכנן הפעלת ריצוף חדשה, השתמש בממשק התכנון של המכשיר או של הפעלת הענן. לחלופין, באפשרותך לייבא קובץ גיליון דגימות גרסה 2 כדי ליצור הפעלה מתוכננת.
במקרה הצורך, השתמש באחת מהאפשרויות הבאות כדי ליצור גיליון דגימות.
| • | נווט לתוכנת הבקרה מרחוק. בחר את שם ההפעלה ולאחר מכן בחר Export sample sheet (ייצא גיליון דגימות). בחר Export (ייצא) כדי לשמור את גיליון הדגימות. |
| • | תכנן הפעלת ריצוף ב-Run Planning (תכנון הפעלה) של BaseSpace Sequence Hub והשתמש באחסון מקומי. לאחר שתסיים לתכנן את ההפעלה, ייצא את גיליון הדגימות. |
| • | השתמש בגיליון הדגימות הממוקם בתיקיית הפלט של הפעלת ריצוף שהושלמה. |
כדי לתכנן הפעלה במכשיר, נווט אל הכרטיסייה Planned (מתוכנן) במסך Runs (הפעלות). ב-BaseSpace Sequence Hub, השתמש באפשרות לתכנון הפעלה. ספק את המידע הדרוש כמצוין בממשק.
|
הגדרת הפעלה |
פרטים |
|---|---|
|
שם ההפעלה |
שם ייחודי לזיהוי ההפעלה. |
|
תיאור ההפעלה |
תיאור ההפעלה. |
|
פלטפורמת מכשירים |
מערכת הריצוף (NovaSeq X Series). |
|
ניתוח משני |
מציין את מיקום הניתוח המשני. נתח את נתוני הריצוף בענן באמצעות BaseSpace Sequence Hub או במכשיר. |
|
פורמט FASTQ |
תבניות הפלט הבאות זמינות: • gzip • DRAGEN חל רק על הפעלות המשתמשות בניתוח משני מקומי. |
|
מספר המחזורים בכל קריאה |
הזן ערכים עבור קריאה 1, אינדקס 1, אינדקס 2 וקריאה 2. לקבלת מידע נוסף, עיין ב-מספר מחזורים. להפעלת PhiX בלבד, הזן 0 בשני שדות האינדקס. |
|
מזהה מבחנת הספרייה |
המזהה מופיע על התווית של רצועת מבחנות הספרייה. הגדרה זו מכונה גם מזהה מכל דגימה. |
לקבלת מידע על קביעת תצורה לניתוח משני, עיין בהגדרת ניתוח משני.
| 1. | נווט אל הכרטיסייה Planned (מתוכנן) במסך Runs (הפעלות). |
| 2. | בחר Import sample sheet (ייבוא גיליון דגימות), ולאחר מכן פתח את קובץ גיליון דגימות גרסה 2. |
לקבלת מידע על התבנית והדרישות של גיליון הדגימות, עיין בדף התמיכה Sample Sheet v2 Resources (משאבי גיליון דגימות גרסה 2).
| 3. | לאחר אימות גיליון הדגימות, בחר Next (הבא) כדי לסקור את פרטי ההפעלה המיובאים. |
במהלך הסקירה, ניתן לערוך את פרטי ההפעלה המיובאים.
| 4. | [אופציונלי] בצע כל אחת מהפעולות הבאות: |
• כדי לערוך את הגדרות ההפעלה או את הגדרות התצורה, בחר באפשרות Edit (עריכה) שלצד ההפעלה או התצורה.
• כדי למחוק תצורה, בחר Delete (מחק) לצד התצורה ולאחר מכן בחר Yes, Delete (כן, מחק).
• כדי להוסיף תצורת ניתוח נוספת להפעלה, בחר Add another configuration (הוסף תצורה נוספת).
| 5. | כדי לשמור את ההפעלה, בחר אחת מהאפשרויות הבאות. |
• כדי לערוך את פרטי ההפעלה מאוחר יותר, בחר Save as draft (שמור כטיוטה).
• כדי לסיים את פרטי ההפעלה ולתכנן את הריצוף, בחר Save as planned (שמור כמתוכנן).
