פריימרים מותאמים אישית

כדי להשתמש בפריימרים מותאמים אישית עבור הפעלה נדרשים השלבים הנוספים הבאים במהלך הגדרת ההפעלה:

הכן והוסף את הנפח המתאים של כל פריימר מותאם אישית למיקומי הפריימר המותאמים אישית של מחסנית הריאגנט.
במהלך סקירת ההפעלה, הגדר את ההפעלה לשימוש עם פריימר מותאם אישית.
עבור תוכנת בקרה מסדרת NovaSeq X בגרסה 1.2 או מוקדמת יותר, הורד את קובץ ה-XML המתאים של מתכון הפריימר המותאם אישית מדף סדרת NovaSeq X באתר התמיכה של Illumina. העלה את מתכון הפריימר המותאם אישית במהלך סקירת ההפעלה.
עבור תוכנת הבקרה מסדרת NovaSeq X בגרסה 1.3 ואילך, בחר את תיבות הסימון הרלוונטיות של הפריימר המותאם אישית. העלאת מתכון מותאם אישית משביתה את תיבות הסימון של הפריימר המותאם אישית.

כל השלבים האחרים פועלים בהתאם לזרימת העבודה הסטנדרטית. עיין Protocol להוראות פרוטוקול ריצוף.

כאשר נעשה שימוש בפריימרים מותאמים אישית לקריאה 1 או לקריאה 2, התוכנה מכוונת את המכשיר למשיכה מפתחים CP1 ו-CP2. לכן, בהפעלת הריצוף לא נעשה שימוש בפריימרים של Illumina. פריימרים של Illumina מתייחסים לפריימרים שכבר נמצאים במחסנית הריאגנט.

אם לא נעשה שימוש בפריימרים של Illumina לקריאה 1 או לקריאה 2, בקרת PhiX האופציונלית של Illumina אינה עוברת ריצוף. כדי להשתמש בבקרת PhiX עם פריימרים מותאמים אישית, פנה לתמיכה הטכנית של Illumina לקבלת הנחיות.

מכיוון ש-PhiX אינו באינדקס, נתוני ריצוף מפקד PhiX אינם נוצרים עבור קריאות אינדקס ללא קשר באיזה פריימר אינדקס נעשה שימוש.