Prvo postavljanje

Kontrolni softver serije MiSeq i100 vodi vas kroz prvu pripremu. Sljedeći odjeljci sažimaju postavke konfiguracije koje treba konfigurirati tijekom početnog postavljanja.

Ne ometajte instrument ako je prikazan pokazivač čekanja koji se vrti. Ometanje postupka može dovesti do kritične pogreške sustava nakon koje nije moguć oporavak.

Da biste stvorili točne podatke o rezultatima obrade, morate postaviti vremensku zonu instrumenta nakon dovršetka instalacije. Pogledajte Postavke vremena.

Administratorski račun

Tijekom prvog postavljanja možete izraditi samo jedan administratorski račun. Nakon što se postavi, možete kreirati dodatne administratorske račune. Za više informacija pogledajte Dodavanje korisnika.

• Korisničko ime
• Lozinka

Nadimak instrumenta

• [Neobavezno] nadimak instrumenta

Ako unesete nadimak instrumenta, on se prikazuje na dnu zaslona u upravljačkom softveru Kontrolni softver serije MiSeq i100.

Mrežna veza

Konfiguriranje mrežne veze tijekom postupka prvog postavljanja nije obavezno, ali se preporučuje. Ako ne konfigurirate mrežu, morate konfigurirati USB ili vanjsku pohranu. Ne možete upotrebljavati Illumina Proactive, BaseSpace Sequence Hub, ni bilo koje druge usluge u oblaku dok se mreža ne postavi.

Kako biste koristili statičku IP adresu, ručno unesite IP adresu ili koristite Protokol za dinamičku konfiguraciju glavnog računala (DHCP) za automatizaciju dodjele IP adrese.

• Automatsko dodjeljivanje IP adrese (DHCP)
• Ručno unesite IP adresu
– IP adresa
– mrežna maska
– pristupnik

Ako ručno unosite DNS poslužitelje, možete uključiti više poslužitelja odvajajući ih zarezom. Ako sustav MiSeq i100 nije na domeni, možete potražiti domenu da biste dobili rezoluciju naziva.

• Automatsko dodjeljivanje IP adrese DNS poslužitelja
• [Neobavezno] Ručno unesite IP adresu DNS poslužitelja
– IP adresa DNS poslužitelja
• [Neobavezno] Pretraži domenu

Ako je proxy poslužitelj omogućen, prikazuje se mogućnost za unos korisničkog imena i lozinke za autentificirani proxy poslužitelj.

• [Neobavezno] Omogući proxy
– adresa poslužitelja
– [Neobavezno] priključak 
– zahtijeva korisničko ime i lozinku
• korisničko ime
• Lozinka

Ako morate daljinski pristupiti instrumentu MiSeq i100, morate omogućiti priključke 80 i 443.

• Omogućite mrežne priključke 80 i 443 za daljinski pristup

Illumina Proactive

Illumina Proactive odabrana je prema zadanim postavkama.

• Slanje podataka o radnim svojstvima instrumenta tvrtki Illumina. Nisu poslani podaci o sekvenciranju.

Provjere sustava

Nakon uspostave potrebnih konfiguracija pokreću se provjere sustava kako bi se osiguralo pravilno funkcioniranje svih komponenti instrumenta MiSeq i100. Provjere sustava uključuju testiranje vrata protočnog članka, ventilatora za unutarnje hlađenje i mehanizama za umetanje reagensa. Ne ometajte instrument dok obavlja provjere sustava. Provjere sustava upotrebljavaju uloške za mokro i suho ispitivanje za višekratnu uporabu koji se isporučuju s instrumentom MiSeq i100.

Umetnite uloške testa za višekratnu uporabu na sljedeći način.

1. Odaberite Next (Sljedeće) kako biste izvukli suhu pliticu.
2. Postavite suhi uložak za testiranje nakon što se suha plitica izvuče.
3. Odaberite Next (Sljedeće) kako biste uvukli suhu pliticu i izvukli mokru pliticu.
4. Postavite mokri uložak za testiranje nakon što se mokra plitica izvuče.
5. Odaberite Next (Sljedeće) kako biste uvukli mokru pliticu i pokrenuli provjere sustava.

Nemojte ručno podešavati plitice. To može dovesti do kritične pogreške sustava nakon koje nije moguć oporavak.

Ako provjere sustava identificiraju neuspjehe, provjere sustava se nastavljaju dok se ne provjere sve komponente. Sveobuhvatan popis neuspjelih komponenti bilježi se u datoteke zapisnika. Obratite se službi za tehničku podršku tvrtke Illumina kako biste podijelili datoteke zapisnika i riješili sve probleme putem rješavanja problema.

Nakon dovršetka provjera sustava izvadite uložak za mokro ispitivanje za višekratnu uporabu i uložak za suho ispitivanje za višekratnu uporabu odabirom opcije Eject consumables (Izbacivanje potrošnog materijala) s početnog zaslona. Čuvajte uloške na sobnoj temperaturi za buduću uporabu.

Vanjska pohrana

Mrežna pohrana – SMB

1. Unesite sljedeće podatke:
• Lokacija poslužitelja
• Domena neobavezno
• Korisničko ime
• Lozinka

Šifriranje

• Zahtijeva šifriranje tijekom prijenosa datoteke.
• Ne zahtijeva šifriranje tijekom prijenosa datoteke.
2. Za testiranje veze mrežne pohrane odaberite Test configuration (Testna konfiguracija).
3. Nakon dovršetka testa odaberite Save (Spremi).
4. Nastavite na Navedite zadanu mapu.

Mrežna pohrana – NFS pohrana

NFS pohrana ne zahtijeva korisničko ime ili lozinku, ali su polja prisutna u upravljačkom softveru Kontrolni softver serije MiSeq i100. Za nastavak možete unijeti bilo koje vrijednosti.

1. Unesite sljedeće podatke:
• Lokacija poslužitelja
• Domena neobavezno
• Korisničko ime
• Lozinka
2. Za testiranje veze mrežne pohrane odaberite Test configuration (Testna konfiguracija).
3. Nakon dovršetka testa odaberite Save (Spremi).
4. Nastavite na Navedite zadanu mapu.

USB pohrana

Dodavanje USB pogona za vanjsku pohranu preporučuje se samo ako MiSeq i100 nije povezan s mrežom. USB pogon može se koristiti i za uvoz lista s uzorcima i datoteka s resursima.

Koristite USB čvorište na preporučenom popisu kako biste izbjegli moguće probleme s montažom i prijenosom podataka. Upute potražite na Serija MiSeq i100 web-mjestu za podršku.

USB pogon mora se konfigurirati na sljedeći način.

• Formatiran na exFAT ili NTFS.
• Sadrži mapu koja će se koristiti kao izlazna mapa. Naziv mape ne može imati razmak.

Mapa se ne može izraditi u upravljačkom softveru Kontrolni softver serije MiSeq i100, mora se kreirati prije dodavanja USB-a u instrument.

• Spojeno na USB 3.1 priključak. Pogledajte odjeljak Periferni priključci.
1. Odaberite Add USB (Dodaj USB)

Ako je USB šifriran, unesite lozinku. Nemojte unositi lozinku ako USB nije šifriran.

2. Odaberite Add (Dodaj).
3. Odaberite Save (Spremi).
4. Nastavite na Navedite zadanu mapu.

Navedite zadanu mapu

Nakon dodavanja lokacije vanjske pohrane, sustav Kontrolni softver serije MiSeq i100 odvest će vas na početni zaslon. Prije početka obrade sekvenciranjem potrebno je postaviti zadanu mapu. Pomoću sljedećih koraka postavite zadanu mapu.

1. Odaberite ikonu izbornika u gornjem lijevom kutu.
2. Odaberite Settings (Postavke), a zatim odaberite External storage (Vanjska pohrana).
3. Odaberite Add folder (Dodaj mapu).
4. Odaberite lokaciju poslužitelja s padajućeg popisa, a zatim odaberite volumen.
5. Odaberite željenu zadanu izlaznu mapu iz opcije Available folders (Dostupne mape).
6. [Neobavezno] Unesite nadimak mape.
7. Odaberite Save (Spremi).

Ako ste pretplaćeni na Professional BaseSpace Sequence Hub (BSSH), potreban je naziv privatne domene.

• Lokacija hostinga
• [Neobavezno] Naziv privatne domene