Kompleti za pripremu i prilagodnik indeksiranja za uvoz prilagođene biblioteke

Možete uvesti prilagođene komplete za pripremu biblioteke i prilagodnika indeksa za upotrebu u obradama sekvenciranjem. Da biste uvezli prilagođene komplete morate biti administrator. Komplet prilagođenog prilagodnika indeksa naveden je u kompletu za pripremu biblioteke i mora se uvesti najprije.

Komplete prilagođenih prilagodnika indeksa možete uvesti pomoću dostupnog predloška.

1. Ako je upravljački softver NovaSeq X Series otvoren na instrumentu, minimizirajte upravljački softver. Pogledajte Minimize or Exit the Control Software.
2. Pomoću aplikacije preglednika na instrumentu pristupite udaljenom upravljačkom softveru NovaSeq X Series. Upute potražite u odjeljku Use the Remote NovaSeq X Series Control Software.
3. Otvorite padajući izbornik u gornjem lijevom kutu, a zatim odaberite Custom kits (Prilagođeni kompleti).
4. Da biste preuzeli datoteku TSV predloška, odaberite Download template (Preuzmi predložak).

Datoteka predloška TSV dostupna je samo u udaljenom upravljačkom softveru.

5. Uredite sljedeće odjeljke:

Polja moraju počinjati alfanumeričkim znakom i smiju sadržavati samo alfanumeričke znakove, razdoblja, crtice i podcrte.

• IndexKit (Komplet za indeksiranje) – pregled informacija za komplet prilagodnika indeksa, uključujući naziv, verziju, opis i strategiju indeksa.
• Resources (Resursi) – Omogućuje vam da navedete sljedove adaptera za Read 1 (Očitanje 1) i Read 2 (Očitanje 2). Na temelju vrijednosti u ovom odjeljku, uvezena datoteka postavlja vrstu kompleta indeksa kao jednu od sljedećih opcija:
• Standardni raspored (nefiksan)
• Fiksni raspored (jedna ploča)
• Fiksni raspored ploče (višestruka ploča)
• Indices (Indeksi) – Popis indeksa, uključujući naziv, slijed adaptera i je li indeks za Indeks 1 ili Indeks 2.
6. Uklonite upute predloška uključene u kutne nosače (< >), a zatim spremite TSV datoteku.
7. Odaberite Import index adapter kit (Komplet prilagodnika indeksa uvoza), idite do kompleta prilagodnika prilagođenog indeksa (*.tsv), a zatim odaberite Open (Otvori).
8. Nakon uspješnog uvoza kompleta prilagođenog prilagodnika indeksa, odaberite naziv za pregled i uređivanje informacija.

Upotrijebite sljedeće upute za prijenos prilagođenih kompleta za pripremu biblioteke.

1. Odaberite ikonu instrumenta da biste otvorili globalni navigacijski izbornik.
2. Odaberite Settings (Postavke), a zatim odaberite Custom kits (Prilagođeni kompleti).
3. Odaberite Add library prep kit (Dodaj komplet za pripremu biblioteke), a zatim unesite sljedeće podatke:
• Naziv kompleta za pripremu biblioteke
• [Neobavezno] Opis
• [Neobavezno] Organizacija. Tvrtka ili ustanova koja je vlasnik kompleta za pripremu prilagođene biblioteke. Organizacija ne može biti Illumina.
• Dopuštene vrste čitanja
• Zadana vrsta očitanja
• Zadani ciklus čitanja
4. S padajućeg popisa odaberite barem jedan kompatibilni komplet prilagodnika indeksa.
5. Odaberite Save (Spremi).
6. Nakon uspješnog dodavanja kompleta za pripremu biblioteke odaberite naziv za pregled i uređivanje informacija.