Szekvenálási kimeneti fájlok

Fájltípus	A fájl leírása, helye és neve
Bázisazonosító-fájlok	Minden, elemzésen átesett klaszter bekerül egy bázisazonosító fájlba. Ciklusonként, soronként és felületenként egy ilyen összesítő fájl jön létre. Az összesített fájl tartalmazza minden klaszter bázisazonosítását és a kódolt minőségi pontszámot. Data\Intensities\BaseCalls\L001\C1.1 L[lane]_[surface].cbcl, például L001_1.cbcl
Klaszterhelyfájlok	Minden áramlási cellánál egy bináris klaszterhelyfájl tartalmazza a klaszterek XY koordinátáit az adott mozaikban. A koordinátákat az áramlási cella nanoüreges elrendezéséhez illeszkedő hatszögletű elrendezés határozza meg. Data\Intensities s_[lane].locs
Szűrőfájlok	A szűrőfájl határozza meg, hogy egy klaszter átment-e a szűrőkön. A rendszer a 26. ciklusnál hozza létre a szűrőfájlokat, a 25. ciklus adatai alapján. A rendszer minden mozaikhoz létrehoz egy szűrőfájlt. Data\Intensities\BaseCalls\L001 s_[lane]_[tile].filter
Futtatási információs fájl	Tartalmazza a futtatás nevét, a kiolvasásonkénti ciklusok számát, hogy a kiolvasás indexelt kiolvasás-e, valamint az áramlási cellában lévő rendek és mozaikok számát. A futtatási információs fájl a futtatás elején jön létre. [Root folder], RunInfo.xml

Bázisazonosító-fájlok

Minden, elemzésen átesett klaszter bekerül egy bázisazonosító fájlba. Ciklusonként, soronként és felületenként egy ilyen összesítő fájl jön létre. Az összesített fájl tartalmazza minden klaszter bázisazonosítását és a kódolt minőségi pontszámot.

Data\Intensities\BaseCalls\L001\C1.1

L[lane]_[surface].cbcl, például L001_1.cbcl

Klaszterhelyfájlok

Minden áramlási cellánál egy bináris klaszterhelyfájl tartalmazza a klaszterek XY koordinátáit az adott mozaikban. A koordinátákat az áramlási cella nanoüreges elrendezéséhez illeszkedő hatszögletű elrendezés határozza meg.

Data\Intensities

s_[lane].locs

Szűrőfájlok

A szűrőfájl határozza meg, hogy egy klaszter átment-e a szűrőkön. A rendszer a 26. ciklusnál hozza létre a szűrőfájlokat, a 25. ciklus adatai alapján. A rendszer minden mozaikhoz létrehoz egy szűrőfájlt.

Data\Intensities\BaseCalls\L001

s_[lane]_[tile].filter

Futtatási információs fájl

Tartalmazza a futtatás nevét, a kiolvasásonkénti ciklusok számát, hogy a kiolvasás indexelt kiolvasás-e, valamint az áramlási cellában lévő rendek és mozaikok számát. A futtatási információs fájl a futtatás elején jön létre.

[Root folder], RunInfo.xml