Chimica XLEAP-SBS Riferimento rapido

Questa sezione fornisce una panoramica dei modi in cui l’utilizzo della chimica XLEAP-SBS influisce sul modo in cui gli utenti interagiscono con il sistema di sequenziamento NextSeq 1000/2000. Per utilizzare la chimica XLEAP-SBS, è necessario attenersi ai requisiti di compatibilità e alle modifiche procedurali. Tali requisiti di compatibilità e modifiche procedurali sono descritti qui. Per maggiori dettagli, consultare Protocollo di sequenziamento XLEAP-SBS.

I seguenti aggiornamenti software sono installabili dal cliente. Per le istruzioni di installazione per installazioni online e offline, consultare le Note di rilascio per il cliente del NextSeq 1000/2000 Control Software v1.7 sul sito di supporto Illumina.

Requisiti di compatibilità

Software

• NextSeq 1000/2000 Control Software versione 1.7 o successiva. Le istruzioni per l’installazione e l’installazione del software si trovano nella pagina Download del software del sito di supporto Illumina.
• DRAGEN v4.2 o superiore. Le istruzioni per l’installazione e l’installazione del software si trovano nella pagina Download del software del sito di supporto Illumina.

NextSeq 1000/2000 Control Software v1.7 è compatibile solo con DRAGEN v4.2. Installare entrambi gli aggiornamenti software contemporaneamente. Una volta installati, questi aggiornamenti software non possono essere annullati.

Genoma di riferimento

• Genoma di riferimento DRAGEN v4.2 v9. Scaricare dalla pagina dei file del prodotto dal sito di supporto Illumina.

Modifiche procedurali

• Le concentrazioni di caricamento e i conteggi dei cicli sono cambiati. Consultare Considerazioni sul sequenziamento XLEAP-SBS.
• Le tempistiche di scongelamento richieste per i materiali di consumo XLEAP-SBS sono diverse. Consultare Scongelamento dei materiali di consumo XLEAP-SBS.
• Le procedure di denaturazione e diluizione integrate sono cambiate. Consultare Generatore del protocollo di denaturazione e diluizione.
• La preparazione della cartuccia ora include una fase per ridurre le bolle d’aria e stabilizzare i componenti della cartuccia e l’inversione viene eseguita lentamente. Consultare Preparazione della cartuccia.
• Il binning della tabella Q viene aggiornato per riflettere la migliore qualità di sequenziamento e accuratezza della chimica XLEAP-SBS. Consultare Flusso di lavoro di Real-Time Analysis.
• Nuovo primer personalizzato per XLEAP-SBS. Consultare Primer personalizzati.
• Nuove ricette del ciclo 'dark' per XLEAP-SBS. Consultare Sequenziamento con cicli 'dark'.