Primer personalizzati

Per utilizzare primer personalizzati per una corsa sono necessari i seguenti passaggi aggiuntivi durante la configurazione della corsa:

Preparare e aggiungere il volume appropriato di ciascun primer personalizzato alle posizioni del primer personalizzato della cartuccia di reagenti.
Durante la revisione della corsa, configurare la corsa per l’uso dei primer personalizzati.
Per il Software di controllo NovaSeq X Series v1.2 e versioni precedenti, scaricare il file XML della ricetta del primer personalizzato appropriato dalla pagina NovaSeq X Series sul sito di supporto Illumina. Caricare la ricetta del primer personalizzato durante la revisione della corsa.
Per il Software di controllo NovaSeq X Series v1.3 e versioni successive, selezionare le caselle di spunta dei primer personalizzati pertinenti. Il caricamento di una ricetta personalizzata disabilita le caselle di spunta del primer personalizzato.

Tutti gli altri passaggi seguono il flusso di lavoro standard. Consultare il Protocollo per le istruzioni del protocollo di sequenziamento.

Quando si utilizzano primer personalizzati per la Read 1 (Lettura 1) o la Read 2 (Lettura 2), il software ordina allo strumento di estrarre i pozzetti CP1 e CP2. Pertanto, i primer Illumina non vengono utilizzati per la corsa di sequenziamento. I primer Illumina si riferiscono ai primer già presenti nella cartuccia di reagenti.

Se i primer Illumina non vengono utilizzati per la Read 1 (Lettura 1) o la Read 2 (Lettura 2), il controllo PhiX Illumina facoltativo non viene sequenziato. Per utilizzare il controllo PhiX con primer personalizzati, contattare l’Assistenza tecnica Illumina per indicazioni.

Poiché PhiX non è indicizzato, i dati di sequenziamento del controllo PhiX non vengono generati per le letture indici a prescindere dal primer indicizzazione utilizzato.