Primer personalizzati
Per utilizzare primer personalizzati per una corsa sono necessari i seguenti passaggi aggiuntivi durante la configurazione della corsa:
• | Preparare e aggiungere il volume appropriato di ciascun primer personalizzato alle posizioni del primer personalizzato della cartuccia di reagenti. |
• | Durante la revisione della corsa, configurare la corsa per l’uso dei primer personalizzati. |
– | Per il Software di controllo NovaSeq X Series v1.2 e versioni precedenti, scaricare il file XML della ricetta del primer personalizzato appropriato dalla pagina NovaSeq X Series sul sito di supporto Illumina. Caricare la ricetta del primer personalizzato durante la revisione della corsa. |
– | Per il Software di controllo NovaSeq X Series v1.3 e versioni successive, selezionare le caselle di spunta dei primer personalizzati pertinenti. Il caricamento di una ricetta personalizzata disabilita le caselle di spunta del primer personalizzato. |
Tutti gli altri passaggi seguono il flusso di lavoro standard. Consultare il Protocollo per le istruzioni del protocollo di sequenziamento.
Quando si utilizzano primer personalizzati per la Read 1 (Lettura 1) o la Read 2 (Lettura 2), il software ordina allo strumento di estrarre i pozzetti CP1 e CP2. Pertanto, i primer Illumina non vengono utilizzati per la corsa di sequenziamento. I primer Illumina si riferiscono ai primer già presenti nella cartuccia di reagenti.
Se i primer Illumina non vengono utilizzati per la Read 1 (Lettura 1) o la Read 2 (Lettura 2), il controllo PhiX Illumina facoltativo non viene sequenziato. Per utilizzare il controllo PhiX con primer personalizzati, contattare l’Assistenza tecnica Illumina per indicazioni.
Poiché PhiX non è indicizzato, i dati di sequenziamento del controllo PhiX non vengono generati per le letture indici a prescindere dal primer indicizzazione utilizzato.