Monitoraggio del progresso della corsa
È possibile monitorare il progresso della corsa, annullare una corsa o avviare una nuova corsa nella schermata Sequencing (Sequenziamento). È possibile monitorare il progresso della corsa integrata sullo strumento o utilizzando un computer in rete. Se il monitoraggio della corsa da cloud è abilitato, è possibile visualizzare il progresso della corsa in BaseSpace Sequence Hub. Per visualizzare ulteriori dettagli e lo stato della corsa, consultare Gestione delle corse.
Per visualizzare metriche e visualizzazioni aggiuntive, è possibile utilizzare Sequencing Analysis Viewer (SAV). Per ulteriori informazioni su SAV, consultare la pagina del sito di supporto Sequencing Analysis Viewer.
Se, in qualsiasi momento, la corsa viene annullata, viene eseguito automaticamente un lavaggio post-corsa. Se un lavaggio post-corsa non riesce o non viene eseguito a causa di un errore, eseguire un lavaggio di manutenzione prima di iniziare una nuova corsa di sequenziamento. Consultare Esecuzione di un lavaggio di manutenzione per istruzioni.
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1.
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Monitorare lo stato della corsa nella schermata Sequencing (Sequenziamento) o nella scheda Active (Attivo) nella schermata Runs (Corse). |
La schermata Sequencing (Sequenziamento) contiene il tempo stimato di completamento della corsa, che richiede 10 corse precedenti per calcolare accuratamente il tempo di completamento della corsa.
La scheda Active (Attivo) nella schermata Runs (Corse) include l’ora di avvio del processo e ulteriori informazioni sullo stato della corsa. Lo stato indica quali delle seguenti attività sono in corso:
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Trasferimento dei dati di sequenziamento all’unità di archiviazione esterna |
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Trasferimento file esterno |
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Trasferimento dei dati dell’analisi secondaria all’unità di archiviazione esterna |
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2.
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Monitorare le seguenti metriche nella schermata Sequencing (Sequenziamento) o Runs (Corse). |
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% ≥ Q30: la percentuale delle identificazioni delle basi con un punteggio qualitativo ≥ 30. |
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Yield (Resa): il numero di identificazioni delle basi previsto per la corsa. |
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Total reads PF (PF totale letture): il numero di letture paired-end (se pertinente) che attraversano il filtro (in milioni). |
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3.
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Per riconsultare eventuali dettagli aggiuntivi della corsa, selezionare il nome della corsa nella schermata Sequencing (Sequenziamento) o nella scheda Active (Attivo) nella schermata Runs (Corse). |
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4.
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Al termine della corsa, è possibile visualizzare ulteriori risultati selezionando il nome della corsa nella schermata Sequencing (Sequenziamento) o nella scheda Completed (Completato) nella schermata Runs (Corse). |
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5.
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Lasciare i materiali di consumo nello strumento. Non rimuoverli fino a quando non viene richiesto durante la configurazione della corsa successiva. |
