RTAフォルダーおよびファイル

次の表では、一次解析中にReal-Time Analysis（RTA）によって生成されるフォルダーとファイルがリストされています。これらのファイルの多くはLocal Run Managerソフトウェアによる二次解析に使用されます。

キーファイル	サブフォルダー	内容説明
RTAComplete.txt	ルートフォルダー	ベースコール解析が完了すると生成されるマーカーファイル。このファイルが存在することで、二次解析が開始されます。
SampleSheet.csv	ルートフォルダー	このファイルは、ランの前に読み取られてランフォルダーにコピーされ、後に二次解析に使用されます。
RunInfo.xml	ルートフォルダー	リードの区切り（インデックスリードを含む）と、ランに対して選択されたクオリティテーブルが特定されます。
*.bclファイル	Data\ Intensities\BaseCalls\ L001\CX.X	各*.bclファイルには、1サイクルの1タイルに対するRTAベースコーリングと塩基のクオリティスコアリングの結果が含まれます。
*.statsファイル	Data\ Intensities\BaseCalls\ L001\CX.X	*.statsファイルには、特定のサイクル/タイルに対するRTAベースコーリング統計が含まれます。
*.filterファイル	Data\ Intensities\BaseCalls	*.filterファイルには、タイルごとのフィルター結果が含まれます。
*.txt	Data\RTALogs	一次解析からのログファイル。
*.cifファイル	Data\ Intensities\L001\CX.X	バイナリ形式の各*.cifファイルには、1サイクルの1タイルに対するRTAイメージ解析結果が含まれます。詳細については、「フローセルタイルの番号付け」を参照してください。
*.locsファイル	Data\ Intensities\BaseCalls\ L001	クラスターの座標をレポートします。各*.locsファイルは1タイルを表します。
*.jpgファイル	Thumbnail_Images\ L001\CX.X	それぞれのサイクルと塩基に対して生成されたサムネイルイメージ。ランのトラブルシューティングに使用できます。これらのファイルはイメージ解析に用いられ、解析フォルダーにはコピーされません。イメージファイル名については、「フローセルタイルの番号付け」を参照してください。