フォルダー

シーケンス中および装置上の解析中に、以下のフォルダーが出力フォルダーにコピーされます。

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<ランフォルダー名>\Alignment：装置上の二次解析で生成されたデータを格納します。解析出力ファイルの詳細については、使用している解析モジュールのワークフローガイドを参照してください。

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<ランフォルダー名>\Config：ランの構成ファイルを格納します。

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<ランフォルダー名>\Data：サブフォルダーとしてintensitiesとRTALogsがあります。

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<ランフォルダー名>\Data\RTA Logs：各リードに対してRTAが実行した個々のステップが記述されたログファイルを格納します。

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<ランフォルダー名>\Data\Intensities\BaseCalls：ベースコール（*.bcl）ファイル、マトリックスファイル、およびフェージングファイルを含むサブフォルダーがあります。Local Run Manager解析モジュールは、二次解析中に、このフォルダーまたは<ランフォルダー名>\AlignmentにFASTQファイルを書き込みます。FASTQファイルを探すときは、両方の場所を参照してください。

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<ランフォルダー名>\Recipe：ランに使用されたレシピを格納します。

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<ランフォルダー名>\Logs：各サイクルに対して装置が実行した個々のステップが記述されたログファイルを格納します。

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<ランフォルダー名>\InterOp：クラスター密度、強度、クオリティスコア、全体的なラン品質などの各種一次解析メトリクスを要約するためにSequencing Analysis Viewer（SAV）によって使用されるバイナリファイルを格納します。

一時的なランフォルダーで作成されるすべての他のファイルおよびフォルダーは、出力フォルダーおよび解析フォルダーにコピーされません。解析やトラブルシューティングに必要のない一時ファイルを含みます。

Local Run Managerは二次解析中に、Alignmentフォルダーなどの他のフォルダーを追加します。詳細については、『Local Run Manager v4 Software Guide』（文書番号：200036672）を参照してください。