シーケンス出力ファイル

解析された各クラスターは、サイクル、レーン、および面ごとに1つのベースコールファイルに集約されます。この集約されたファイルには、すべてのクラスターのベースコールとエンコードされたクオリティスコアが含まれます。

Data\Intensities\BaseCalls\L001\C[cycle_number]1.1

L[lane]_[surface].cbcl（例：L001_1.cbcl）

フローセルごとに作成されるバイナリー形式のクラスターロケーションファイルには、タイル内のクラスターのXY座標が含まれます。フローセルのナノウェルレイアウトと一致する正方形レイアウトにより、座標があらかじめ定められます。

Data\Intensities

s_[lane].locs

フィルターファイルは、クラスターがフィルターを通過したかどうかを示します。ゲノムリード1のサイクル26の時点で（インデックスリードは除外される）、25サイクルまでのデータを使用して作成されます。タイルごとに1つのフィルターファイルが生成されます。

Data\Intensities\BaseCalls\L001

s_[lane]_[tile].filter

ラン名、各リードのサイクル数、リードがインデックスリードであるか、さらにフローセル上のスワスとタイルの数を一覧表示します。ラン情報ファイルは、ランの開始時に生成されます。

[Root folder]\RunInfo.xml