სამომხმარებლო პრაიმერები
Index First სამუშაო პროცესში სამომხმარებლო პრაიმერების მხარდაჭერა არ ხდება
• | მოამზადეთ და დაამატეთ თითოეული სამომხმარებლო პრაიმერის, ან სამომხმარებლო პრაიმერის ნარევის შესაბამისი მოცულობა მშრალ კარტრიჯზე სამომხმარებლო პრაიმერის ღრმულში. |
• | დააყენეთ პარამეტრები ეკრანზე |
ყველა სხვა ნაბიჯი შეესაბამება გაშვების დაყენების სამუშაო პროცესს. იხილეთ გაშვების დაყენება სტანდარტული პრაიმერისთვის და შემდეგ გადადით პროტოკოლი პროტოკოლის სეკვენირების ინსტრუქციების სანახავად.
სტანდარტული პრაიმერები და PhiX
როდესაც სტანდარტული პრაიმერები გამოიყენება წაკითხვა 1-ის ან წაკითხვა 2-ისთვის, პროგრამული უზრუნველყოფა მიმართავს ხელსაწყოს შესაბამისი სტანდარტული პრაიმერის ამოსაღებად. ამიტომ, Illumina-ს პრაიმერები სეკვენირების გაშვებისთვის არ გამოიყენება.
თუ Illumina პრაიმერები წაკითხვა 1-ის ან წაკითხვა 2-ისთვის არ გამოიყენება, Illumina PhiX კონტროლის დამატებითი სეკვენირება არ ხდება. იმისათვის, რომ გამოიყენოთ PhiX კონტროლი სტანდარტული პრაიმერებით, რეკომენდაციისთვის მიმართეთ Illumina-ს ტექნიკური დახმარების სამსახურს.
იმის გამო, რომ PhiX არ არის ინდექსირებული, ინდექსის წაკითხვისთვის PhiX კონტროლისგან სეკვენსირების მონაცემების შექმნა არ ხდება, განურჩევლად იმისა, თუ ინდექსირების რომელი პრაიმერი გამოიყენება.
პრაიმერის პოზიციები მშრალ კარტრიჯზე
თქვენ შეგიძლიათ გამოიყენოთ Illumina პრაიმერებისა და სტანდარტული პრაიმერების კომბინაცია იმავე გაშვებაში. მითითებული კომბინაციიდან გამომდინარე, პროგრამული უზრუნველყოფა ამოიღებს პრაიმერს შესაბამისი რეზერვუარიდან. მაგალითად, თუ სტანდარტული პრაიმერი გამოიყენება წაკითხვა 2-ისთვის, მაგრამ არა წაკითხვა 1-ისთვის, პროგრამული უზრუნველყოფა ამოიღებს წაკითხვა 1 პრაიმერს Illumina-ს პრაიმერის ღრუდან და წაკითხვა 2 პრაიმერს სამომხმარებლო პრაიმერის ღრუდან.