ឯកសារលទ្ធផលការវិភាគបន្ទាប់បន្សំ DRAGEN

ផ្នែកនេះផ្តល់ព័ត៌មានអំពីកម្មវិធី DRAGEN នីមួយៗ រួមទាំងព័ត៌មានឯកសារលទ្ធផល។ បន្ថែមពីលើការបង្កើតឯកសារជាក់លាក់ចំពោះកម្មវិធីនីមួយៗ DRAGEN ផ្តល់នូវម៉ាទ្រីចពីការវិភាគនៅក្នុងឯកសារ <sample_name>.metrics.json និងរបាយការណ៍ដែលបានពិពណ៌នានៅក្នុង របាយការណ៍វិភាគបន្ទាប់បន្សំ MiSeq i100 Plus។ សម្រាប់ព័ត៌មានបន្ថែមអំពី DRAGEN យោងទៅ ទំព័របណ្តាញជំនួយការវិភាគបន្ទាប់បន្សំ DRAGEN។

រាល់បំពង់កែវ DRAGEN គាំទ្រដល់ការបង្រួមបញ្ចូល BCL និងការបង្ហាប់ឯកសារ BAM/CRAM លទ្ធផល។ ឯកសារ BAM មិនត្រូវបានផ្ទុកឡើងទៅ ការវិភាគបន្ទាប់បន្សំ DRAGEN ប្រសិនបើសកម្ម ការត្រួតពិនិត្យដំណើរការ និងការផ្ទុកត្រូវបានជ្រើសរើស។

DRAGEN BCL កម្មវិធីបម្លែងគាំទ្រមុខងារដូចខាងក្រោម៖

• ការបង្រួមទិន្នន័យ BCL បញ្ចូល
• ការញែកគំរូ
• UMI និងការគ្រប់គ្រងអង្គបន្ស៊ាំ
• ការកំណត់ក្នុងគំរូមួយ
• ការបង្កើតឯកសារ FASTQ
• ការបង្ហាប់ឯកសារ FASTQ ទៅជាទម្រង់ ORA ឬ Gzip
• ការបង្កើតម៉ាទ្រីច FASTQ QC (សម្រាប់តែគំរូ 1024 ដំបូងប៉ុណ្ណោះ)

កម្មវិធី DRAGEN Analysis BCL គាំទ្រមុខងារដូចខាងក្រោម៖

• បណ្ណាល័យការគណនាតុល្យភាពឡើងវិញ
• ម៉ាទ្រីច QC
– ម៉ាទ្រីចបណ្ណាល័យ
– ម៉ាទ្រីចការធ្វើផែនទី
– ម៉ាទ្រីចគ្របដណ្តប់
• ការបង្កើតម៉ាទ្រីច FASTQ QC (សម្រាប់តែគំរូ 1024 ដំបូងប៉ុណ្ណោះ)

កម្មវិធី DRAGEN Small Whole Genome គាំទ្រមុខងារដូចខាងក្រោម៖

• ការធ្វើផែនទី/ការតម្រឹម
• ការហៅតាមប្រភេទតូច
• ការបង្កើតម៉ាទ្រីច FASTQ QC (សម្រាប់តែគំរូ 1024 ដំបូងប៉ុណ្ណោះ)

កម្មវិធី DRAGEN Microbial Enrichment Plus គាំទ្រមុខងារពិសេសដូចខាងក្រោម៖

• គំរូ QC/dehosting
• ការរកឃើញមេរោគ និងបរិមាណ
• មេរោគ WGS
• ការវិភាគសញ្ញាសម្គាល់ភាពធន់នឹងថ្នាំសំលាប់មេរោគ (AMR)
• ការវិភាគមេរោគ/ខ្សែសង្វាក់ (Nextclade)