Мрежни врски
Системите на Illumina се дизајнирани да проследуваат податоци со редовна каденца за време на активноста на секвенционирањето. Во зависност од стапката на празнење, овој пренос на податоци може да опстојува некое време по завршувањето на секвенционирањето. Illumina инструментите заземаат претежно нагорна мрежа. Прекините на мрежата може да влијаат на преносот на податоци. Ако дојде до прекин на мрежата, инструментите се дизајнирани да ги кешираат сите податоци локално. Сепак, таквото кеширање може да го одложи почетокот на следната обработка со секвенционирање, во зависност од просторот за складирање на инструментот. Инструментите се дизајнирани за повторно да започнат пренос на податоци по обновувањето на мрежата.
Прегледајте ги активностите за одржување на мрежата за потенцијални ризици за компатибилност со MiSeq i100 Plus System.
За информации за барањата за складирање податоци за секој тип на датотека, погледнете во Illumina Контрола на инструменти Компјутерска безбедност и вмрежување.
Користете ги следниве насоки за инсталирање и конфигурирање мрежна врска:
• | Користете посебна врска помеѓу инструментот и системот за управување со податоци. Користете го етернет кабелот вклучен со инструментот. Оваа врска може да се воспостави директно или преку мрежен прекинувач. |
– | Потребна е интранет конекција од 1 гигабит (Gb) во секунда (инструмент со мрежно складирање и граничен firewall) за одржување на времето на пренос на податоци. Пониските брзини на поврзување резултираат со намалена достапност на инструментот, зголемено време на пренос на податоци и може да влијаат на перформансите на обработката со секвенционирање. |
– | Интернет-врската е изборна. |
• | Се препорачуваат управувани прекинувачи. |
• | Пресметајте го вкупниот капацитет на работното оптоварување на секој мрежен прекинувач. Бројот на поврзани инструменти и помошна опрема, како на пример печатач, може да влијае врз капацитетот. |
• | Ако е можно, изолирајте го сообраќајот за секвенционирање од другиот мрежен сообраќај. |
• | За мрежно проврзување, обезбеден е незаштитен мрежен кабел долг 3 м (9,8 ft) со инструментот. Се препорачува кабел CAT-6A за кабли подолги од 50 м (164 ft). |
Користете го следниов препорачан мрежен пропусен опсег по инструмент за поврзувања базирани на 85–90% мрежна ефикасност. Примарните датотеки за анализа вклучуваат излезни датотеки за секвенционирање RTA и BCL. Датотеките за секундарна анализа вклучуваат излезни датотеки на DRAGEN на инструментот.
– | 800 мегабити во секунда (Mb/s) (само примарни) или ~1 гигабити во секунда (Gb/s) (примарна и секундарна) одржлива мрежна ширина на опсег за локално складирање на податоци. |
– | 800 Mb/s мрежен пропусен опсег за прикачување на примарни податоци за анализа на cloud. |
– | 15 Mb/s мрежен пропусен опсег за следење на обработка или само за проактивна поддршка на Illumina. |
MiSeq i100 Plus користи мрежна врска од > 1 Gb/s помеѓу инструментот и мрежното складирање. Користењето врска од <1 Gb/s може да резултира со подолго време на копирање или да го одложи почетокот на последователните обработки со секвенционирање.
Излезни врски
Врска |
Вредност |
Намена |
---|---|---|
Порта |
53 |
Резолуција на име на Домен со клиенти на DNS сервери |
Порта |
80 |
Конфигурација BaseSpace Sequence Hub или Illumina Proactive |
Порта |
443 |
UI или UCS софтвер за контрола надвор од инструментот |
Порта |
8080 |
Конфигурација BaseSpace Sequence Hub или Illumina Proactive |
Влезни врски
Влезните порти се стандардно затворени. Тие можат да се отворат во контролниот софтвер на MiSeq i100 Plus. Погледнете во Поставки за Firewall.
Врска |
Вредност |
Намена |
---|---|---|
Порта |
80 |
Софтвер за контрола надвор од инструментот (сертификат) |
Порта |
443 |
Софтвер за контрола надвор од инструментот (UI) |