Подгответе сув картриџ
Потрошниот материјал за MiSeq i100 Plus се испорачува и чува на собна температура. Не е потребно одмрзнување. Пред да ги ставите библиотечните материјали во сувиот картриџ, разредете ги библиотечните материјали и изборно спајкувајте го PhiX. Библиотечните материјали автоматски се денатурираат на инструментот.
Секогаш вршете анализа за контрола на квалитетот и оптимизирајте ја концентрацијата на полнење за вашиот библиотечен материјал.
Разреди библиотечен материјал
|
1.
|
Користете ножици за да ја отсечете фолијата од пакувањето на влажниот картриџ за да ги извадите епруветите RSB и KLD. Ставете ги епруветите настрана. |
Чувајте го влажниот картриџ во фолијата од пакувањето додека не биде подготвен за полнење. Влажниот картриџ мора да се употреби во рок од 4 часа по отворањето на фолијата.
|
2.
|
Разредете го библиотечниот материјал до 10x концентрација на полнење со помош на пуфер за ресуспензија (RSB). |
Пример: За конечна концентрација на полнење од 100 pM, разредете до 1 nM.
|
3.
|
Вртете на највисока поставка 3 секунди, а потоа кратко центрифугирајте. |
|
4.
|
[Изборно] спајкување на PhiX на следниов начин. |
|
а.
|
Разредете го PhiX до 6x концентрација на полнење на библиотечен материјал со RSB. |
Пример: За конечна концентрација на полнење од 100 pM, разредете го PhiX до 0,6 nM.
|
b.
|
Додадете 1uL од ова разредување во библиотечната смеса со 10x концентрација на полнење. |
Волумените произведуваат приближно 2% спајкување на PhiX. Процентот варира во зависност од квалитетот и квантитетот на библиотечниот материјал.
|
5.
|
Во нова епрувета за микроцентрифуга од 1,5 мл, комбинирајте ги следните волумени за да го разредите библиотечниот материјал до конечната концентрација на полнење: |
|
•
|
10x концентрација на полнење на библиотечен материјал (30 µl) |
|
6.
|
Вртете на највисока поставка 3 секунди, а потоа кратко центрифугирајте. |
|
7.
|
Чувајте ја смесата на мраз додека не биде подготвена за употреба. |
Разредениот раствор на библиотечен материјал е стабилен до 6 часа кога се чува на мраз или на 4ºC.
Наполни библиотечен материјал
|
1.
|
Облечете нов пар ракавици без пудра за да избегнете контаминација. |
|
2.
|
Користете ножици за да ја отсечете фолијата од пакувањето на сувиот картриџ. |
Употребете го сувиот картриџ во рок од 4 часа по отворањето на фолијата.
|
3.
|
Извадете го сувиот картриџ од пакувањето. |
Фатете го сувиот картриџ за страните за да избегнете допирање на проточната ќелија.
|
4.
|
Фрлете ја фолијата од пакувањето соодветно. |
|
5.
|
Користејќи чист врв на пипета, прободете ја заптивката од фолијата што го покрива бунарот за реагенс означен со Library (Библиотечен материјал). |
|
6.
|
Пипетирајте 250 µl разреден бибилиотечен раствор во бунарот Библиотечен материјал во сувиот картриџ. |
|
7.
|
Изборно Пипетирајте го прилагодениот прајмер во соодветна порта на сувиот картриџ. Погледнете во Прилагодени прајмери. |