ပထမအကြိမ် စနစ်ထည့်သွင်းခြင်း

MiSeq i100 Plus Control Software သည် ပထမဆုံးအကြိမ် စီစဉ်သတ်မှတ်မှုမှတစ်ဆင့် သင့်အား လမ်းပြပေးသည်။ အောက်ဖော်ပြပါ ကဏ္ဍများတွင် ကနဦးတပ်ဆင်မှုအတွင်း စီစဉ်သတ်မှတ်ရမည့် စီစဉ်သတ်မှတ်မှု ဆက်တင်များကို အကျဉ်းချုပ်ဖော်ပြပေးသည်။

လည်နေသော စောင့်ဆိုင်း ကာဆာကို ပြသနေပါက ကိရိယာကို မနှောင့်ယှက်ပါနှင့်။ လုပ်ငန်းစဉ် နှောင့်ယှက်မှုသည် ပြန်မရနိုင်သည့် အရေးကြီးသော စနစ် အမှားအယွင်းကို ဖြစ်စေနိုင်သည်။

စီမံခန့်ခွဲသူအကောင့်

ပထမအကြိမ် စနစ်ထည့်သွင်းစဉ်တွင် သင်သည် စီမံခန့်ခွဲသူအကောင့်တစ်ခုသာ ဖန်တီးနိုင်သည်။ ၎င်းကို စနစ်ထည့်သွင်းပြီးနောက်၊ သင်သည် နောက်ထပ်စီမံခန့်ခွဲသူအကောင့်များကို ဖန်တီးနိုင်သည်။ ပိုမိုသိရှိလိုပါက အသုံးပြုသူများ ထည့်မည် ကို ကိုးကားပါ။

• အသုံးပြုသူအမည်
• စကားဝှက်

ကိရိယာအမည်ပြောင်

• [ချန်လှပ်ထားနိုင်သည်] ကိရိယာအမည်ပြောင်

ကိရိယာအမည်ပြောင်ကို သင်ထည့်သွင်းပါက၊ ၎င်းကို MiSeq i100 Plus Control Software ရှိ စခရင်အောက်ခြေတွင် ပြသမည်ဖြစ်သည်။

ကွန်ရက်ချိတ်ဆက်မှု

ပထမဆုံးအကြိမ် တပ်ဆင်မှုလုပ်ငန်းစဉ်အတွင်း ကွန်ရက်ချိတ်ဆက်မှု စီစဉ်သတ်မှတ်ခြင်းကို ကျော်သွားနိုင်သော်လည်း တစ်ပါတည်းလုပ်ပေးပါရန် အကြံပြုထားသည်။ ကွန်ရက်ကို စီစဉ်သတ်မှတ်ခြင်း မပြုပါက၊ USB သို့မဟုတ် ပြင်ပသိုလှောင်မှုကို စီစဉ်သတ်မှတ်ပေးရပါမည်။ ကွန်ရက်ကို စနစ်ထည့်သွင်းမပြီးမချင်း Illumina Proactive၊ BaseSpace Sequence Hub သို့မဟုတ် အခြား ကလောက်ဒ် ဝန်ဆောင်မှုများကို သင်အသုံးမပြုနိုင်ပါ။

Static IP လိပ်စာကိုအသုံးပြုရန်၊ IP လိပ်စာကို ကိုယ်တိုင်ရိုက်ထည့်ပါ သို့မဟုတ် IP လိပ်စာ၏ သတ်မှတ်ချက်ကို အလိုအလျောက်လုပ်ဆောင်ရန် Dynamic Host Configuration Protocol (DHCP) ကို အသုံးပြုပါ။

• IP လိပ်စာ (DHCP) ကို အလိုအလျောက် သတ်မှတ်မည်
• IP လိပ်စာကို ကိုယ်တိုင်ရိုက်ထည့်ပါ
– IP လိပ်စာ
– Netmask
– Gateway

DNS ဆာဗာများကို ကိုယ်တိုင်ထည့်သွင်းနေပါက၊ ဆာဗာများစွာကို ကော်မာဖြင့် ပိုင်းခြားခြင်းဖြင့် ထည့်သွင်းနိုင်သည်။ MiSeq i100 Plus သည် ဒိုမိန်းတွင် မရှိပါက အမည် ဆုံးဖြတ်ချက်ကို ရရှိရန် ဒိုမိန်းကို သင်ရှာဖွေနိုင်ပါသည်။

• DNS server IP လိပ်စာကို အလိုအလျောက် သတ်မှတ်ပေးမည်
• DNS ဆာဗာ IP လိပ်စာကို ကိုယ်တိုင်ရိုက်ထည့်ပါ ချန်လှပ်ထားနိုင်သည်
– DNS ဆာဗာ(များ) IP လိပ်စာ
• ဒိုမိန်း ရှာမည် ချန်လှပ်ထားနိုင်သည်

ပရောက်စီဆာဗာကို ဖွင့်ထားပါက စစ်မှန်ကြောင်းအတည်ပြုထားသော ပရောက်စီတစ်ခုအတွက် အသုံးပြုသူအမည်နှင့် စကားဝှက်ကို ထည့်သွင်းရန် ရွေးချယ်ခွင့်တစ်ခုကို ဖော်ပြသည်။

• [ချန်လှပ်ထားနိုင်သည်] ပရောက်စီကို ဖွင့်ထားမည်
– ဆာဗာလိပ်စာ
– [ချန်လှပ်ထားနိုင်သည်] အပေါက် 
– အသုံးပြုသူအမည်နှင့် စကားဝှက် လိုအပ်သည်
• အသုံးပြုသူအမည်
• စကားဝှက်
• ဒေသစံတော်ချိန်
• NTP လိပ်စာ ချန်လှပ်ထားနိုင်သည်

အကယ်၍ သင်သည် MiSeq i100 Plus ကို အဝေးမှဝင်ရောက်ရမည်ဆိုပါက၊ အပေါက် 80 နှင့် 443 တို့ကို ဝင်ရောက်အသုံးပြုရမည်။

• အဝေးမှဝင်ရောက်ခွင့်အတွက် ကွန်ရက်အပေါက် 80 နှင့် 443 ကို ဖွင့်ပါ။

Illumina Proactive

Illumina Proactive ကို ပုံသေ ရွေးချယ်ထားသည်။

• ကိရိယာ စွမ်းဆောင်ရည်ဒေတာကို Illumina သို့ ပို့ပါ။ ဒြပ်ပေါင်းအစီအစဉ်ဆုံးဖြတ်ရေး ဒေတာကို မပို့ပါ။

စနစ်စစ်ဆေးမှုများ

လိုအပ်သောဖွဲ့စည်းပုံများ ထည့်သွင်းပြီးနောက်၊ MiSeq i100 Plus အစိတ်အပိုင်းများအားလုံးကို သင့်လျော်စွာလုပ်ဆောင်နိုင်စေရန်အတွက် စနစ်စစ်ဆေးမှုများကို စတင်လုပ်ဆောင်ပါသည်။ စနစ်စစ်ဆေးမှုများတွင် စီးဆင်းမှု ဆဲလ် တံခါး၊ အတွင်းအအေးခံပန်ကာနှင့် ဓာတ်စမ်းပစ္စည်း ရယူရေး ယန္တရားများ ပါဝင်ပါသည်။ ကိရိယာသည် စနစ်စစ်ဆေးမှုများကို ခံယူနေသောကြောင့် ကိရိယာကို မနှောင့်ယှက်ပါနှင့်။ စနစ်စစ်ဆေးမှုများသည် MiSeq i100 Plus တွင် ပါရှိသော ပြန်သုံးနိုင်သော အစိုနှင့် အခြောက် ကတ်ထရစ်တောင့်များကို အသုံးပြုသည်။

အောက်ဖော်ပြပါအတိုင်း ပြန်သုံးနိုင်သော စမ်းသပ်ကတ်ထရစ်တောင့်များကို ထည့်ပါ။

1. ဗန်းအခြောက်ကို ဆန့်ထုတ်ရန် Next (ရှေ့သို့) ကို ရွေးပါ။
2. ဗန်းအခြောက်ကို ဆန့်ထုတ်ပြီးနောက် စမ်းသပ်ကတ်ထရစ်တောင့်အခြောက်ကို ထည့်ပါ။
3. ဗန်းအခြောက်ကို ပြန်ရုပ်သိမ်းရန်နှင့် ဗန်းအစိုကို ဆန့်ထုတ်ရန် Next (ရှေ့သို့) ကို ရွေးချယ်ပါ။
4. ဗန်းအစိုကို ဆန့်ထုတ်ပြီးနောက် စမ်းသပ်ကတ်ထရစ်တောင့်အခြောက်ကို ထည့်ပါ။
5. ဗန်းအစိုကို ပြန်ရုပ်သိမ်းပြီး စနစ်စစ်ဆေးမှုများကို စတင်ရန် Next (ရှေ့သို့) ကို နှိပ်ပါ။

ဗန်းများကို ကိုယ်တိုင်မချိန်ညှိပါနှင့်။ ထိုသို့လုပ်ဆောင်ခြင်းသည် ပြန်လည်မွမ်းမံ၍မရသော အရေးကြီးသောစနစ်အမှားကို ဖြစ်ပေါ်စေနိုင်သည်။

စနစ်စစ်ဆေးမှုသည် ချို့ယွင်းချက်တစ်စုံတစ်ရာကို ခွဲခြားသိမြင်ပါက၊ အစိတ်အပိုင်းအားလုံးကို စစ်ဆေးပြီးသည်အထိ စနစ်စစ်ဆေးမှုများ ဆက်လက်လုပ်ဆောင်ပါသည်။ မအောင်မြင်သော အစိတ်အပိုင်းများ၏ ပြည့်စုံသောစာရင်းကို မှတ်တမ်းဖိုင်များတွင် မှတ်တမ်းတင်ထားသည်။ မှတ်တမ်းဖိုင်များကို မျှဝေခြင်းနှင့် ပြဿနာဖြေရှင်းခြင်းမှတစ်ဆင့် မည်သည့်ပြဿနာများကိုမဆို ဖြေရှင်းရန် Illumina နည်းပညာပံ့ပိုးကူညီမှုထံ ဆက်သွယ်ပါ။

စနစ်စစ်ဆေးမှုများ ပြီးသွားပြီးနောက်၊ Start (စတင်မည်) စခရင်မှ Eject Consumables (အသွင်းပစ္စည်းများကို ထုတ်မည်) ကို ရွေးခြင်းဖြင့် ပြန်သုံး၍ရသော စမ်းသပ် ကတ်ထရစ်တောင့်အစိုနှင့် ပြန်သုံး၍ရသော စမ်းသပ် ကတ်ထရစ်တောင့်အခြောက်တို့ကို ဖယ်ထုတ်လိုက်ပါ။ နောင်အသုံးပြုရန်အတွက် ကတ်ထရစ်တောင့်များကို ပတ်ဝန်းကျင်အပူချိန်တွင် သိမ်းဆည်းပါ။

ပြင်ပသိုလှောင်မှု

ကွန်ရက်သိုလှောင်မှု - SMB

1. အောက်ပါအချက်အလက်များကို ထည့်သွင်းပါ-
• ဆာဗာတည်နေရာ
• ဒိုမိန်း ချန်လှပ်ထားနိုင်သည်
• အသုံးပြုသူအမည်
• စကားဝှက်

ကုဒ်ဝှက်ခြင်း

• ဖိုင်လွှဲပြောင်းနေစဉ်အတွင်း ကုဒ်ဝှက်ရန် လိုအပ်သည်။
• ဖိုင်လွှဲပြောင်းနေစဉ်အတွင်း ကုဒ်ဝှက်ခြင်းကို မလိုအပ်ပါ။
2. ကွန်ရက်သိုလှောင်မှု ချိတ်ဆက်ခြင်းကို စမ်းသပ်ရန် Test configuration (စီစဉ်သတ်မှတ်ခြင်းကို စမ်းသပ်မည်) ကို ရွေးချယ်ပါ။
3. စမ်းသပ်မှုပြီးပါက Save (သိမ်းမည်) ကို ရွေးချယ်ပါ။
4. Specify default folder (ပုံသေဖိုင်တွဲကို သတ်မှတ်မည်) ကို ဆက်လုပ်ပါ။

ကွန်ရက်သိုလှောင်မှု - NFS သိုလှောင်မှု

NFS သိုလှောင်မှုတွင် အသုံးပြုသူအမည် သို့မဟုတ် စကားဝှက် မလိုအပ်သော်လည်း အကွက်များသည် MiSeq i100 Plus Control Software တွင် ရှိနေသည်။ ရှေ့ဆက်ရန် တန်ဖိုးတစ်ခုခုကို ထည့်သွင်းနိုင်သည်။

1. အောက်ပါအချက်အလက်များကို ထည့်သွင်းပါ-
• ဆာဗာတည်နေရာ
• ဒိုမိန်း ချန်လှပ်ထားနိုင်သည်
• အသုံးပြုသူအမည်
• စကားဝှက်
2. ကွန်ရက်သိုလှောင်မှု ချိတ်ဆက်ခြင်းကို စမ်းသပ်ရန် Test configuration (စီစဉ်သတ်မှတ်ခြင်းကို စမ်းသပ်မည်) ကို ရွေးချယ်ပါ။
3. စမ်းသပ်မှုပြီးပါက Save (သိမ်းမည်) ကို ရွေးချယ်ပါ။
4. Specify default folder (ပုံသေဖိုင်တွဲကို သတ်မှတ်မည်) ကို ဆက်လုပ်ပါ။

USB သိုလှောင်မှု

MiSeq i100 Plus ကို ကွန်ရက်တစ်ခုနှင့် ချိတ်ဆက်မထားမှသာ ပြင်ပသိုလှောင်မှုအတွက် USB ဒရိုက်ကို ထည့်ရန် အကြံပြုပါသည်။ နမူနာစာရွက်များနှင့် အရင်းအမြစ်ဖိုင်များကို တင်သွင်းရန်အတွက် USB ဒရိုက်ကိုလည်း အသုံးပြုနိုင်သည်။

USB ဒရိုက်ကို အောက်ပါအတိုင်း သီးသန့်စီစဉ်ရပါမည်။

• exFAT သို့မဟုတ် NTFS သို့ ဖော်မတ်ချထားသည်။
• အထွက်ဖိုင်တွဲအဖြစ် အသုံးပြုရန် ဖိုင်တွဲတစ်ခုကို ထည့်သွင်းပါ။ ဖိုင်တွဲအမည်တွင် နေရာလွတ်မရှိရပါ။

ဖိုင်တွဲကို MiSeq i100 Plus Control Software တွင် ဖန်တီး၍မရပါ၊ ကိရိယာသို့ USB မထည့်မီ ၎င်းကို ဖန်တီးရပါမည်။

• USB 3.1 အပေါက်သို့ ချိတ်ဆက်ထားသည်။ အရန်ချိတ်ဆက်မှုများ ကို ကိုးကားပါ။
1. Add USB (USB ထည့်မည်) ကို ရွေးပါ

USB ကို ကုဒ်ဝှက်ထားပါက၊ စကားဝှက်ကို ရိုက်ထည့်ပါ။ USB ကို ကုဒ်ဝှက်မထားပါက စကားဝှက်မထည့်ပါနှင့်။

2. Add (ထည့်မည်) ကို ရွေးပါ။
3. Save (သိမ်းမည်) ကို ရွေးပါ။
4. Specify default folder (ပုံသေဖိုင်တွဲကို သတ်မှတ်မည်) ကို ဆက်လုပ်ပါ။

ပုံသေဖိုင်တွဲကို သတ်မှတ်ပါ

စက်တွင်း ကွန်ရက်သိုလှောင်မှုတစ်ခုကို ပေါင်းထည့်ပြီးနောက်၊ MiSeq i100 Plus Control Software သည် သင့်အား Start (စတင်မည်) စခရင်သို့ ခေါ်ဆောင်သွားပါမည်။ ဒြပ်ပေါင်းအစီအစဉ်ဆုံးဖြတ်ခြင်း လုပ်ဆောင်မှုကို မစတင်မီ ပုံသေဖိုင်တွဲကို စနစ်ထည့်သွင်းရပါမည်။ ပုံသေဖိုင်တွဲကို သတ်မှတ်ရန် အောက်ပါအဆင့်များကို အသုံးပြုပါ။

1. Upper-left (အပေါ်ဘယ်) ထောင့်ရှိ မီနူးအိုင်ကွန်ကို ရွေးပါ။
2. Settings (ဆက်တင်များ) ကို ရွေးပါ၊ ထို့နောက်External storage (ပြင်ပသိုလှောင်မှု) ကို ရွေးပါ။
3. Add folder (ဖိုင်တွဲထည့်မည်) ကို ရွေးပါ။
4. ဆွဲချစာရင်းမှ ဆာဗာတည်နေရာကို ရွေးပါ၊ ထို့နောက် ပမာဏကို ရွေးပါ။
5. Available folders (ရနိုင်သောဖိုင်တွဲများ) မှ အလိုရှိသော ပုံသေအထွက်ဖိုင်ကို ရွေးချယ်ပါ။
6. [ချန်လှပ်ထားနိုင်သည်] ဖိုင်တွဲအမည်ဝှက်တစ်ခု ထည့်ပါ။
7. Save (သိမ်းမည်) ကို ရွေးပါ။

အကယ်၍ သင်သည် Professional BaseSpace Sequence Hub (BSSH) သို့ စာရင်းသွင်းထားပါက၊ ကိုယ်ပိုင် ဒိုမိန်းအမည်ကို လိုအပ်ပါသည်။

• လက်ခံ တည်နေရာ
• [ချန်လှပ်ထားနိုင်သည်] ကိုယ်ပိုင် ဒိုမိန်းအမည်