ကွန်ရက်ချိတ်ဆက်မှုများ

ဒြပ်ပေါင်းအစီအစဉ်ဆုံးဖြတ်ရေး လုပ်ဆောင်မှုအတွင်း ပုံမှန် cadence ဖြင့် ဒေတာ စီးဆင်းစေရန် Illumina စနစ်များကို ဒီဇိုင်းထုတ်ထားသည်။ ဝန်မပါ နှုန်းပေါ်မူတည်၍ ဒြပ်ပေါင်းအစီအစဉ်ဆုံးဖြတ်ရေး ပြီးဆုံးပြီးနောက် အချိန်အတန်ကြာ ဤဒေတာစီးဆင်းမှု ဆက်ရှိနေနိုင်သည်။ Illumina ကိရိယာများသည် အများအားဖြင့် လိုင်းကောင်းသော ကွန်ရက်ကို လိုအပ်သည်။ ကွန်ရက်ပြတ်တောက်မှုများသည် ဒေတာပေးပို့ခြင်းကို ထိခိုက်စေနိုင်သည်။ ကွန်ရက်ပြတ်တောက်မှု ဖြစ်ပွားပါက ဒေတာအားလုံးကို စက်တွင်း၌ သိမ်းဆည်းရန် ကိရိယာများကို ဒီဇိုင်းထုတ်ထားသည်။ သို့သော်၊ ထိုသို့သော ယာယီဒေတာသိမ်းခြင်းသည် ကိရိယာတွင် သိုလှောင်မှုနေရာပေါ်မူတည်၍ နောက်ဆက်တွဲလုပ်ဆောင်မှုစတင်ခြင်းကို နှောင့်နှေးစေနိုင်သည်။ ကွန်ရက် ပြန်ကောင်းလာပြီးနောက် ဒေတာလွှဲပြောင်းခြင်းကို ပြန်လည်စတင်ရန် ကိရိယာများကို ဒီဇိုင်းထုတ်ထားသည်။

MiSeq i100 Plus System ဖြင့် ဖြစ်နိုင်ခြေရှိသော လိုက်ဖက်ညီမှုအန္တရာယ်များအတွက် ကွန်ရက်ထိန်းသိမ်းခြင်းဆိုင်ရာ လုပ်ဆောင်ချက်များကို ပြန်လည်သုံးသပ်ပါ။

ဖိုင်အမျိုးအစားတစ်ခုစီအတွက် ဒေတာသိမ်းဆည်းမှု လိုအပ်ချက်များနှင့်ပတ်သက်သည့် အချက်အလက်အတွက်၊ Illumina ကိရိယာ ထိန်းချုပ် ကွန်ပျူတာ လုံခြုံရေးနှင့် ကွန်ရက်ချိတ်ဆက်ခြင်း ကို ကိုးကားပါ။

ကွန်ရက်ချိတ်ဆက်မှုတစ်ခုကို ထည့်သွင်းပြီး သတ်မှတ်ရန် အောက်ပါလမ်းညွှန်ချက်များကို အသုံးပြုပါ။

•

ကိရိယာနှင့် ဒေတာစီမံခန့်ခွဲမှုစနစ်အကြား သီးခြားချိတ်ဆက်မှုကို အသုံးပြုပါ။ ကိရိယာနှင့်အတူပါရှိသော အီသာနက်ကြိုးကို အသုံးပြုပါ။ ဤချိတ်ဆက်မှုကို တိုက်ရိုက် သို့မဟုတ် ကွန်ရက်ခလုတ်တစ်ခုမှတစ်ဆင့် ပြုလုပ်ပါ။

–

ဒေတာလွှဲပြောင်းချိန်များကို ထိန်းသိမ်းရန် တစ်စက္ကန့်လျှင် 1 ဂစ်ဂါဘစ် (Gb/s) အင်ထရာနက်ချိတ်ဆက်မှု (ကွန်ရက်သိုလှောင်မှုနှင့် နယ်နိမိတ်ဖိုင်းဝေါလ်သို့ ကိရိယာ) လိုအပ်သည်။ ချိတ်ဆက်မှုအမြန်နှုန်းများ နိမ့်ကျခြင်းကြောင့် ကိရိယာရရှိနိုင်မှု၊ ဒေတာလွှဲပြောင်းချိန်များ တိုးလာကာ ဒြပ်ပေါင်းအစီအစဉ်ဆုံးဖြတ်ရေး လုပ်ဆောင်မှု စွမ်းဆောင်ရည်ကို ထိခိုက်စေနိုင်သည်။

–

အင်တာနက်ချိတ်ဆက်မှုကို ချန်လှပ်ထားနိုင်သည်။

•

စီမံခန့်ခွဲထားသော ခလုတ်များကို အကြံပြုထားသည်။

•

ကွန်ရက်ခလုတ်တစ်ခုစီရှိ အလုပ်ဝန်၏စုစုပေါင်း ဝင်ဆံ့အားကို တွက်ချက်ပါ။ ပရင်တာကဲ့သို့ ချိတ်ဆက်ထားသော ကိရိယာများနှင့် နောက်ဆက်တွဲပစ္စည်းများ အရေအတွက်သည် စွမ်းဆောင်ရည်ကို သက်ရောက်မှုရှိနိုင်သည်။

•

ဖြစ်နိုင်ပါက ဒြပ်ပေါင်းအစီအစဉ်ဆုံးဖြတ်ရေး လမ်းကြောင်းကို အခြားကွန်ရက်အသွားအလာမှ ခွဲထုတ်ပါ။

•

3 မီတာ (9.8 ပေ) အရှည်ရှိသော အကာအရံမပါသော ကွန်ရက်ကြိုးကို ကွန်ရက်ချိတ်ဆက်မှုအတွက် ကိရိယာနှင့်အတူ ပံ့ပိုးပေးထားသည်။ 50 မီတာ (164 ပေ) ထက် ရှည်သော ကေဘယ်ကြိုးများအတွက် CAT-6A ကေဘယ်လ်ကို အကြံပြုထားသည်။

85-90% ကွန်ရက်ထိရောက်မှုအပေါ် အခြေခံ၍ ချိတ်ဆက်မှုများအတွက် အောက်ပါအကြံပြုထားသည့် ကွန်ရက်လှိုင်းခွင်ကို အသုံးပြုပါ။ ပင်မခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုဖိုင်များတွင် RTA နှင့် BCL ဒြပ်ပေါင်းအစီအစဉ်ဆုံးဖြတ်ရေးထုတ်ပေးသည့် ဖိုင်များပါဝင်သည်။ ဆင့်ပွားခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုဖိုင်များတွင် DRAGEN ရလဒ်ဖိုင်များ ပါဝင်ပါသည်။

–

တစ်စက္ကန့်လျှင် 800 megabits (Mb/s) (မူလအတွက်သာ) သို့မဟုတ် တစ်စက္ကန့်လျှင် ~1 gigabits (Gb/s) (မူလနှင့် ဆင့်ပွား) ဒေတာသိမ်းဆည်းရန်အတွက် ကွန်ရက် bandwidth ကို ထိန်းထားနိုင်သည်။

–

ကလောက်ဒ်သို့ ပင်မခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုဒေတာကို အပ်လုဒ်တင်ခြင်းအတွက် 800 Mb/s ကွန်ရက် လှိုင်းခွင်။

–

လုပ်ဆောင်မှု စောင့်ကြည့်ခြင်း သို့မဟုတ် Illumina Proactive Support အတွက်သာ 15 Mb/s ကွန်ရက် လှိုင်းခွင်။

MiSeq i100 Plus သည် ကိရိယာနှင့် ကွန်ရက် သိုလှောင်မှုကြား> 1 Gb/s ကွန်ရက်ချိတ်ဆက်မှုကို အသုံးပြုသည်။ < 1 Gb/s ချိတ်ဆက်မှုကို အသုံးပြုခြင်းသည် ပိုကြာမြင့်သော ကူးယူချိန်များကို ဖြစ်စေနိုင်သည် သို့မဟုတ် နောက်ဆက်တွဲ ဒြပ်ပေါင်းအစီအစဉ်ဆုံးဖြတ်ရေး လုပ်ဆောင်မှုများ၏ စတင်ချိန်ကို ကြန့်ကြာစေနိုင်သည်။

ပြင်ပချိတ်ဆက်မှုများ

ချိတ်ဆက်မှု	တန်ဖိုး	ရည်ရွယ်ချက်
အပေါက်	53	သုံးစွဲသူ DNS ဆာဗာများဖြင့် ဒိုမိန်းအမည် ဆုံးဖြတ်ချက်
အပေါက်	80	BaseSpace Sequence Hub သို့မဟုတ် Illumina Proactive စီစဉ်သတ်မှတ်မှု
အပေါက်	443	Off-instrument control ဆော့ဖ်ဝဲ UI သို့မဟုတ် UCS
အပေါက်	8080	BaseSpace Sequence Hub သို့မဟုတ် Illumina Proactive စီစဉ်သတ်မှတ်မှု

အတွင်း ချိတ်ဆက်မှုများ

Inbound Port များကို မူရင်းအတိုင်း ပိတ်ထားသည်။ ၎င်းတို့ကို MiSeq i100 Plus Control Software တွင် ဖွင့်နိုင်သည်။ ဖိုင်းရားဝေါ ဆက်တင်များ ကို ကိုးကားပါ။

ချိတ်ဆက်မှု	တန်ဖိုး	ရည်ရွယ်ချက်
အပေါက်	80	စက်ပြင်ပ ထိန်းချုပ်ဆော့ဖ်ဝဲ (လက်မှတ်)
အပေါက်	443	စက်ပြင်ပ ထိန်းချုပ်ဆော့ဖ်ဝဲ (UI)