Połączenia sieciowe

Systemy Illumina są zaprojektowane do strumieniowego przesyłania danych w regularnych odstępach czasu podczas czynności sekwencjonowania. W zależności od szybkości odciążania transmisja danych może trwać przez pewien czas po zakończeniu sekwencjonowania. Aparaty Illumina zakładają, że sieć jest zazwyczaj dostępna. Przerwy w działaniu sieci mogą mieć wpływ na transmisję danych. W przypadku awarii sieci urządzenia będą przechowywać w lokalnej pamięci podręcznej wszystkie dane. Jednak taka pamięć podręczna może opóźnić rozpoczęcie kolejnego cyklu sekwencjonowania, w zależności od miejsca przechowywania na przyrządzie. Aparaty są przeznaczone do wznowienia przesyłania danych po przywróceniu działania sieci.

Należy sprawdzić czynności konserwacyjne dotyczące sieci pod kątem potencjalnych zagrożeń zgodności z systemem MiSeq i100 Plus.

Informacje na temat wymagań dotyczących przechowywania danych dla każdego typu pliku można znaleźć w dokumencie Bezpieczeństwo i praca w sieci komputera sterującego aparatem firmy Illumina.

Podczas instalowania i konfiguracji połączenia sieciowego należy stosować się do następujących wytycznych:

•

Należy mieć dedykowane połączenie między aparatem a systemem zarządzania danymi. Należy użyć kabla Ethernet dołączonego do urządzenia. Połączenie to należy utworzyć bezpośrednio lub przez przełącznik sieciowy.

–

Do zachowania czasu przesyłania danych wymagane jest połączenie intranetowe (połączenie aparatu z sieciową pamięcią masową i zapora) o przepustowości 1 Gb/s. Niższe prędkości połączenia skutkują mniejszą dostępnością aparatu oraz dłuższym czasem przesyłania danych i mogą mieć wpływ na wydajność przebiegu sekwencjonowania.

–

Połączenie z Internetem jest opcjonalne.

•

Zalecane jest stosowanie zarządzanych przełączników.

•

Należy obliczyć całkowite dopuszczalne obciążenie każdego przełącznika sieciowego. Liczba podłączonych aparatów i wyposażenie pomocnicze (np. drukarka) mogą mieć wpływ na tę zdolność.

•

W miarę możliwości należy odizolować ruch związany z sekwencjonowaniem od innego ruchu w sieci.

•

Na potrzeby połączeń sieciowych do aparatu dołączony jest nieekranowany kabel sieciowy o długości 3 m (9,8 stopy). Kabel CAT-6A jest zalecany w przypadku konieczności zastosowania kabli o długości powyżej 50 m (164 stóp).

W przypadku połączeń o wydajności 85–90% należy użyć następującej zalecanej przepustowości sieci na przyrząd. Pliki analizy pierwotnej obejmują pliki wyjściowe sekwencjonowania RTA and BCL. Pliki analizy wtórnej obejmują pliki wyjściowe DRAGEN w aparacie.

–

Utrzymująca się przepustowość sieci 800 megabitów na sekundę (Mb/s) (tylko pierwotne) lub ~1 gigabita na sekundę (Gb/s) (pierwotne i wtórne) do lokalnego przechowywania danych.

–

Przepustowość sieci 800 Mb/s do przesyłania danych z analizy pierwotnej do chmury.

–

Przepustowość sieci 15 Mb/s tylko do monitorowania przebiegu i Illumina Proactive Support.

MiSeq i100 Plus wykorzystuje połączenie sieciowe >1 Gb/s między aparatem i sieciową pamięcią masową. Użycie połączenia <1 Gb/s może spowodować wydłużenie czasu kopiowania lub opóźnienie rozpoczęcia kolejnych przebiegów sekwencjonowania.

Połączenia wychodzące

Połączenie	Wartość	Przeznaczenie
Port	53	Rozwiązywanie problemów z nazwami domen za pomocą serwerów DNS klienta
Port	80	Konfiguracja platformy BaseSpace Sequence Hub lub usługi Illumina Proactive
Port	443	Interfejs użytkownika lub UCS oprogramowania sterującego poza aparatem
Port	8080	Konfiguracja platformy BaseSpace Sequence Hub lub usługi Illumina Proactive

Połączenia przychodzące

Porty przychodzące są domyślnie zamknięte. Można je otworzyć za pomocą oprogramowania sterującego MiSeq i100 Plus. Patrz Ustawienia zapory sieciowej.

Połączenie	Wartość	Przeznaczenie
Port	80	Oprogramowanie sterujące poza aparatem (certyfikat)
Port	443	Oprogramowanie sterujące poza aparatem (interfejs użytkownika)