Przygotowanie laboratorium do procedur reakcji PCR

Niektóre metody przygotowywania biblioteki wymagają procesu reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR).

Aby zapobiec zanieczyszczeniu produktów reakcji PCR, przed rozpoczęciem pracy w laboratorium należy wydzielić osobne strefy i opracować odpowiednie procedury laboratoryjne. Produkty reakcji PCR mogą zanieczyszczać odczynniki, aparaty i próbki, opóźniając zwykłe działania oraz powodując uzyskiwanie niedokładnych wyników.

Obszary do etapów przed reakcją PCR i po niej

Należy stosować się do podanych poniżej wytycznych, aby uniknąć zanieczyszczenia krzyżowego.

•

Należy wydzielić obszar dla etapu przed reakcją PCR do procesów przed reakcją PCR.

•

Należy wydzielić obszar dla etapu po reakcji PCR do przetwarzania produktów reakcji PCR.

•

Nie należy używać jednego zlewu do mycia materiałów pochodzących z etapów przed reakcją PCR i po niej.

•

Nie należy używać jednego systemu oczyszczania wody do obszarów dla etapów przed reakcją PCR i po niej.

•

Należy przechowywać materiały eksploatacyjne używane do protokołów przed reakcją PCR w obszarze dla etapu przed reakcją PCR. Należy je przenosić do obszaru dla etapu po reakcji PCR w miarę potrzeb.

Dedykowane wyposażenie i materiały eksploatacyjne

•

Nie należy używać tego samego wyposażenia i materiałów eksploatacyjnych do procesów przed reakcją PCR i po niej. Należy używać oddzielnego zestawu wyposażenia i materiałów eksploatacyjnych w każdej strefie.

•

Należy wydzielić osobne obszary przechowywania materiałów eksploatacyjnych używanych w każdej strefie. Wymagania dotyczące temperatury przechowywania i wymiarów materiałów eksploatacyjnych można znaleźć w części Materiały eksploatacyjne do sekwencjonowania.