Criar uma corrida planejada
Para planejar uma nova corrida do sequenciamento, use a interface de planejamento de corrida no instrumento ou na nuvem. Como alternativa, você pode importar um arquivo de planilha de amostras v2 para criar uma corrida planejada.
Se necessário, use uma das opções a seguir para gerar uma planilha de amostras:
| • | Navegue até o software de controle remoto. Selecione o nome da corrida e, em seguida, selecione Export sample sheet (Exportar planilha de amostras). Selecione Export (Exportar) para salvar a planilha de amostras. |
| • | Planeje uma corrida do sequenciamento no BaseSpace Sequence Hub Run Planning e use o armazenamento local. Depois de concluir o planejamento da corrida, exporte a planilha de amostras. |
| • | Use uma planilha de amostras localizada na pasta de saída de uma corrida do sequenciamento concluída. |
Criar uma corrida
Para planejar uma corrida no instrumento, navegue até a guia Planned (Planejado) na tela Runs (Corridas). Em BaseSpace Sequence Hub, use a opção de planejamento de corrida. Forneça as informações necessárias conforme indicado na interface.
|
Configurações da corrida |
Detalhes |
||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
Nome da corrida |
Nome exclusivo para identificar a corrida. |
||||||
|
Executar descrição |
Descrição da corrida. |
||||||
|
Plataforma do instrumento |
O sistema de sequenciamento (NovaSeq X Series). |
||||||
|
Análise secundária |
Indica a localização da análise secundária. Analise dados de sequenciamento na nuvem com o BaseSpace Sequence Hub ou no instrumento. |
||||||
|
Formato FASTQ |
Os seguintes formatos de saída estão disponíveis:
Aplica-se apenas a corridas que usam a análise secundária local. |
||||||
|
Número de ciclos em cada leitura |
Insira valores para Leitura 1, Índice 1, Índice 2 e Leitura 2. Para obter mais informações, consulte Number of Cycles. Para uma corrida apenas de PhiX, digite 0 em ambos os campos de índice. |
||||||
|
ID do tubo da biblioteca |
A ID localizada na etiqueta da tira de tubo da biblioteca. Essa configuração também pode ser chamada de ID do recipiente de amostra. |
Para obter informações sobre como configurar uma análise secundária, consulte Set Up Secondary Analysis.
Importar uma planilha de amostras
| 1. | Navegue até a guia Planned (Planejado) na tela Runs (corridas). |
| 2. | Selecione Import sample sheet (Importar planilha de amostras) e abra o arquivo v2 da planilha de amostras. |
Para obter informações sobre a formatação e os requisitos da planilha de amostras v2, consulte a Planilha de amostra v2 Página de suporte de recursos.
| 3. | Depois que a planilha de amostras for validada, selecione Next (Avançar) para revisar os detalhes importados da corrida. |
Durante a revisão, os detalhes importados da corrida são editáveis.
| 4. | [Opcional] Execute qualquer uma das seguintes ações: |
| • | Para editar as definições de corrida ou definições de configuração, selecione Edit (Editar) ao lado da corrida ou configuração. |
| • | Para excluir uma configuração, selecione Delete (Excluir) ao lado da configuração e, em seguida, selecione Yes, delete (Sim, excluir). |
| • | Para adicionar outra configuração de análise à corrida, selecione Add another configuration (Adicionar outra configuração). |
| 5. | Para salvar a corrida, selecione uma das opções a seguir. |
| • | Para editar os detalhes da corrida posteriormente, selecione Save as draft (Salvar como rascunho). |
| • | Para finalizar os detalhes da corrida e planejar o sequenciamento, selecione Save as planned (Salvar conforme planejado). |
