Criar uma execução planejada

Para planejar uma nova execução de sequenciamento, use a interface de planejamento de execução no instrumento ou na nuvem. Como alternativa, você pode importar um arquivo de planilha de amostras v2 para criar uma execução planejada.

Se necessário, use uma das opções a seguir para gerar uma planilha de amostras:

• Navegue até o software de controle remoto. Selecione o nome da execução e, em seguida, selecione Export sample sheet (Exportar planilha de amostras). Selecione Export (Exportar) para salvar a planilha de amostras.
• Planeje uma execução de sequenciamento no BaseSpace Sequence Hub Run Planning e use o armazenamento local. Depois de concluir o planejamento da execução, exporte a planilha de amostras.
• Use uma planilha de amostras localizada na pasta de saída de uma execução de sequenciamento concluída.

Para planejar uma execução no instrumento, navegue até a guia Planned (Planejado) na tela Runs (execuções). No BaseSpace Sequence Hub, use a opção de planejamento de execução. Forneça as informações necessárias conforme indicado na interface.

Configuração de execução

Detalhes

Nome da execução

Nome exclusivo para identificar a execução.

Executar descrição

Descrição da execução.

Plataforma do instrumento

O sistema de sequenciamento (NovaSeq X Series).

Análise secundária

Indica a localização da análise secundária. Analise dados de sequenciamento na nuvem com o BaseSpace Sequence Hub ou no instrumento.

Formato FASTQ

Os seguintes formatos de saída estão disponíveis:

• gzip
• DRAGEN

Aplica-se apenas a execuções que usam a análise secundária local.

Número de ciclos em cada leitura

Insira valores para Leitura 1, Índice 1, Índice 2 e Leitura 2. Para obter mais informações, consulte Número de ciclos.

Para uma execução somente de PhiX, digite 0 em ambos os campos de índice.

ID do tubo da biblioteca

A ID localizada na etiqueta da tira de tubo da biblioteca. Essa configuração também pode ser chamada de ID do recipiente de amostra.

Para obter informações sobre como configurar uma análise secundária, consulte Configurar análise secundária.

1. Navegue até a guia Planned (Planejado) na tela Runs (execuções).
2. Selecione Import sample sheet (Importar planilha de amostras) e abra o arquivo v2 da planilha de amostras.

Para obter informações sobre a formatação e os requisitos da planilha de amostras v2, consulte a página de suporte de recursos da planilha de amostra v2.

3. Depois que a planilha de amostras for validada, selecione Next (Avançar) para revisar os detalhes importados da execução.

Durante a revisão, os detalhes importados da execução são editáveis.

4. [Opcional] Execute qualquer uma das seguintes ações:
• Para editar as definições de execução ou definições de configuração, selecione Edit (Editar) ao lado da execução ou configuração.
• Para excluir uma configuração, selecione Delete (Excluir) ao lado da configuração e, em seguida, selecione Yes, delete (Sim, excluir).
• Para adicionar outra configuração de análise à execução, selecione Add another configuration (Adicionar outra configuração).
5. Para salvar a execução, selecione uma das opções a seguir.
• Para editar os detalhes da execução posteriormente, selecione Save as draft (Salvar como rascunho).
• Para finalizar os detalhes da execução e planejar o sequenciamento, selecione Save as planned (Salvar conforme planejado).