Структура папок выходных данных секвенирования

По умолчанию MiSeq i100 Plus создает файлы выходных данных в папке выходных данных, выбранной на вкладке Settings (Настройки).

Общая структура папки выходных данных

На высоком уровне выходные данные организованы в следующей структуре:

<Output_Folder>/<run_id>/

Analysis (secondary analysis files) Анализ (файлы вторичного анализа)

Config

Data (primary analysis BCL files) Данные (файлы BCL для первичного анализа)

InstrumentAnalyticsLogs

InterOp

Logs (Журналы)

RTAComplete.txt

RTAExited.txt

CopyComplete.txt

RunCompletionStatus.xml

RunInfo.xml

RunParameters.xml

SampleSheet.csv

Структура папки выходных данных DRAGEN

О файлах выходных данных DRAGEN см. в следующей структуре в папке Analysis (Анализ). Эти файлы находятся здесь <Output_Folder>/<run_id>/Analysis/<number>/Data. В зависимости от режимов работы в выход могут быть включены дополнительные файлы и папки.

summary (резюме)

Отображает версию DRAGEN, используемую для вторичного анализа, название приложения и статус анализа для каждого образца.

AggregateReports

Содержит файл report.htm, который представляет собой сводный выходной отчет, организованный приложением DRAGEN.

RunInstrumentAnalyticsMetrics

logs

Secondary_Analysis_Complete.txt