Отслеживание хода выполнения прогона
Вы можете отслеживать ход выполнения прогона или отменить прогон на экране Sequencing (Секвенирование). Вы можете отслеживать ход выполнения прогона на приборе или с помощью Illumina Run Manager. Если у вас включено облачное отслеживание хода выполнения прогона, вы можете наблюдать за ним в приложении BaseSpace Sequence Hub. Чтобы просмотреть дополнительные сведения и статус прогона, см. раздел «Управление прогоном».
Для просмотра дополнительных показателей и визуальных отображений используйте средство просмотра анализа секвенирования Sequencing Analysis Viewer (SAV). Для получения дополнительной информации перейдите на страницу поддержки средства просмотра Sequencing Analysis Viewer.
|
1.
|
Отслеживание статуса прогона на экране Sequencing (Секвенирование) или на вкладке Active (Активные) на экране Runs (Прогоны). |
На экране Sequencing (Секвенирование) содержится ожидаемое время завершения прогона, для точного расчета времени завершения которого необходимы данные о 10 предыдущих прогонах.
Вкладка Active (Активный) на экране Runs (Прогоны) содержит время начала процесса и дополнительную информацию о статусе прогона. Статус указывает, какие из следующих действий выполняются:
|
•
|
передача данных секвенирования во внешнее хранилище; |
|
•
|
передача внешних файлов; |
|
•
|
передача данных вторичного анализа во внешнее хранилище. |
|
2.
|
На экранах Sequencing (Секвенирование) и Runs (Прогоны) можно отслеживать следующие показатели.
|
Показатели прогона недоступны до цикла 26 прочтения 1.
|
•
|
% ≥ Q30 — средняя процентная доля распознанных оснований со значением Q ≥ 30. |
|
•
|
Projected Yield (Предполагаемая производительность) — ожидаемое количество оснований, распознанных в ходе прогона. |
|
•
|
Total reads PF (Общее количество прочтений, прошедших через фильтр): количество парноконцевых (в соответствующих случаях) прочтений, которые успешно прошли через фильтр (в миллионах). |
|
•
|
Total % demux (Общий % демультиплексирования) — процентное значение прочтений, прошедших через фильтр, демультиплексированных за прогон. Этот показатель доступен только для запланированных прогонов или прогонов с импортированными протоколами анализа. |
|
3.
|
Для просмотра дополнительных сведений о прогоне выберите название прогона на экране Sequencing (Секвенирование) или вкладку Active (Активный) на экране Runs (Прогоны). |
|
4.
|
После завершения прогона вы можете просмотреть дополнительные результаты прогона, выбрав его название на экране Sequencing (Секвенирование) или перейдя на вкладку Completed (Завершено) на экране Runs (Прогоны). |
Для извлечения расходных материалов после завершения прогона перейдите к разделу Извлечение использованных расходных материалов.