DRAGEN ද්විතීයික විශ්ලේෂණ ප්‍රතිදාන ගොනු

මෙම කොටස ප්‍රතිදාන ගොනු තොරතුරු ඇතුළුව එක් එක් DRAGEN යෙදුම පිළිබඳ තොරතුරු සපයයි. එක් එක් යෙදුම සඳහා විශේෂිත ගොනු උත්පාදනය කිරීමට අමතරව, DRAGEN මඟින් <sample_name>.metrics.json ගොනුව සහ MiSeq i100 Plus ද්විතියික විශ්ලේෂණ වාර්තාවලවිස්තර කර ඇති වාර්තා විශ්ලේෂණයෙන් ප්‍රමිතික සපයයි. DRAGENපිළිබඳ වැඩි විස්තර සඳහා DRAGEN ද්විතීයික විශ්ලේෂණ ආධාරක අඩවි පිටුව බලන්න.

සියලුම DRAGEN නල මාර්ග BCL ආදාන විසංයෝජනයට සහ ප්‍රතිදාන BAM/CRAM ගොනු සම්පීඩනයට සහාය වේ. ක්‍රියාශීලී, ධාවන අධීක්‍ෂණය සහ ගබඩාව තෝරාගෙන තිබේ නම් DRAGEN ද්විතීයික විශ්ලේෂණයට BAM  ගොනු උඩුගත නොකෙරේ.

DRAGEN BCL පරිවර්තන යෙදුම පහත විශේෂාංග සඳහා සහය දක්වයි:

• ආදාන BCL දත්ත විසංයෝජනය
• සාම්පල බහුවිධකරණය නොකිරීම
• UMI සහ ඇඩප්ටරය හැසිරවීම
• එක් සාම්පල සැකසුම්
• FASTQ ගොනු උත්පාදනය
• FASTQ ගොනු ORA වෙත හෝ Gzip ආකෘති වෙත සම්පීඩනය කිරීම
• FASTQ QC ප්‍රමිතික උත්පාදනය (පළමු සාම්පල 1024 සඳහා පමණි)

DRAGEN පුස්තකාලය QC යෙදුම පහත විශේෂාංග සඳහා සහය දක්වයි:

• පුස්තකාල නැවත සමතුලිත කිරීමේ ගණනය කිරීම්
• QC මිනුම්
– පුස්තකාල ප්‍රමිතික
– සිතියම්කරණ ප්‍රමිතික
– ආවරණ ප්‍රමිතික
• FASTQ QC ප්‍රමිතික උත්පාදනය (පළමු සාම්පල 1024 සඳහා පමණි)

DRAGEN කුඩා සම්පූර්ණ ජෙනෝමය යෙදුම පහත විශේෂාංග සඳහා සහය දක්වයි:

• සිතියම්ගත කිරීම / පෙළගැස්වීම
• කුඩා ප්‍රභේද ඇමතීම
• FASTQ QC ප්‍රමිතික උත්පාදනය (පළමු සාම්පල 1024 සඳහා පමණි)

DRAGEN ක්‍ෂුද්‍ර ජීවී සුපෝෂණය ප්ලස් යෙදුම පහත විශේෂාංග සඳහා සහය දක්වයි:

• සාම්පල QC/dehosting
• ව්‍යාධිජනක හඳුනාගැනීම සහ ප්‍රමාණනය කිරීම
• වෛරස් WGS
• ක්‍ෂුද්‍ර ජීවී ප්‍රතිරෝධය (AMR) සලකුණු විශ්ලේෂණය
• වෛරස් ක්ලේඩ්/පෙළපත් විශ්ලේෂණය (Nextclade)