Voliteľné priméry
Voliteľné priméry nie sú podporované v pracovnom postupe Index First.
| • | Pripravte a pridajte príslušný objem každého voliteľného priméru alebo voliteľnej zmesi primérov do voliteľnej pozície priméru v kazete na reagencie. |
| • | Možnosti voliteľných primérov nakonfigurujete na obrazovke |
Všetky ostatné kroky sa riadia pracovným postupom nastavenia chodu. Pozrite si časť Nastavenie chodu pre voliteľné priméry a potom prejdite k Protokolu, kde nájdete pokyny k protokolu sekvenovania.
Voliteľne priméry a PhiX
Ak sa pre Čítanie 1 alebo 2 použijú voliteľné priméry, softvér nariadi prístroju, aby sa vytiahol z príslušnej voliteľnej jamky priméru. Preto sa priméry spoločnosti Illumina nepoužívajú počas sekvenovacieho chodu.
Ak sa priméry spoločnosti Illumina nepoužívajú na Čítanie 1 alebo Čítanie 2, voliteľný ovládací prvok PhiX spoločnosti Illumina sa nebude sekvenovať. Ak chcete použiť ovládací prvok PhiX s voliteľnými primérmi, požiadajte o radu technickú podporu spoločnosti Illumina.
Keďže kontrola PhiX nie je indexovaná, sekvenčné údaje z kontroly PhiX sa nevygenerujú pre indexové čítania bez ohľadu na to, ktorý indexovací primér sa použije.
Polohy priméru na suchej kazete
V tom istom chode môžete použiť kombináciu primérov spoločnosti Illumina a voliteľných primérov. V závislosti od uvedenej kombinácie softvér vyberie primér z príslušnej nádrže. Ak sa napríklad pre Čítanie 2 použije voliteľný primér, ale nie pre Čítanie 1, softvér použije primér Čítania 1 z jamky priméru spoločnosti Illumina a primér Čítania 2 z jamky voliteľného priméru.
