Mrežne veze
Sistemi Illumina su dizajnirani da strimuju podatke na redovnoj kadenci tokom aktivnosti sekvenciranja. U zavisnosti od brzine van opterećenja, ovaj prenos podataka može trajati neko vreme nakon završetka sekvenciranja. Illumina instrumenti pretpostavljaju da je mreža uglavnom otvorena. Nestanak mreže može uticati na prenos podataka. Ako dođe do nestanka mreže, instrumenti su dizajnirani da lokalno keširaju sve podatke. Međutim, takvo keširanje može odložiti početak sledeće obrade sekvenciranjem, u zavisnosti od prostora za skladištenje na instrumentu. Instrumenti su dizajnirani da ponovo pokrenu prenos podataka nakon ponovnog uspostavljanja mreže.
Proverite aktivnosti održavanja mreže kako bi se utvrdilo da li postoje rizici u pogledu kompatibilnosti sa sistemom MiSeq i100 Plus.
Za informacije o zahtevima za skladištenje podataka za svaki tip datoteke, pogledajte Illumina Kontrola instrumenata Računarska sigurnost i umrežavanje.
Pratite sledeće smernice pri instaliranju i konfigurisanju mrežne veze:
• | Koristite namensku vezu između instrumenta i sistema upravljanja podacima. Koristite Ethernet kabl koji je priložen sa instrumentom. Ova veza treba da bude direktna ili preko mrežnog prekidača (switch-uređaja). |
– | 1 gigabitna po sekundi (Gb/s) intranet veza (instrument za mrežno skladištenje i granični zaštitni zid) je potrebna za održavanje vremena prenosa podataka. Niže brzine povezivanja dovode do smanjene dostupnosti instrumenta, povećanog vremena prenosa podataka i mogu da utiču na performanse obrade sekvenciranjem. |
– | Internet konekcija je opciona. |
• | Preporučuje se upravljanje prekidačima. |
• | Izračunajte ukupni kapacitet radnog opterećenja za svaki mrežni prekidač. Broj priključenih uređaja i pomoćne opreme poput štampača može da utiče na kapacitet. |
• | Ukoliko je moguće, izolujte saobraćaj sekvenciranja od ostalog mrežnog saobraćaja. |
• | Neoklopljeni mrežni kabl dužine 3 m (9,8 ft) obezbeđen je sa instrumentom za mrežne veze. CAT-6A kabl se preporučuje za kablove duže od 50 m (164 ft). |
Koristite sledeći preporučeni mrežni propusni opseg po instrumentu za povezivanje na osnovu 85-90% mrežne efikasnosti. Datoteke primarne analize uključuju RTA i BCL sekvenciranje izlaznih datoteka. Datoteke sekundarne analize uključuju izlazne datoteke DRAGEN na instrumentu.
– | 800 megabita u sekundi (Mb/s) (samo primarni) ili ~1 gigabita u sekundi (Gb/s) (primarni i sekundarni) održiv mrežni propusni opseg za lokalno čuvanje podataka. |
– | 800 Mb/s mrežni propusni opseg za otpremanje podataka primarne analize u oblak. |
– | 15 Mb/s mrežni propusni opseg samo za praćenje obrade ili Illumina proaktivnu podršku. |
MiSeq i100 Plus koristi > 1 Gb/s mrežnu vezu između instrumenta i mrežnog skladišta. Korišćenje < 1 Gb/s veze može da dovede do dužih vremena kopiranja ili odlaganja početka naknadnih obrada sekvenciranjem.
Izlazne veze
Veza |
Vrednost |
Svrha |
---|---|---|
Port |
53 |
Rezolucija imena domena sa DNS serverima klijenta |
Port |
80 |
BaseSpace Sequence Hub ili Illumina proaktivna konfiguracija |
Port |
443 |
Korisnički interfejs ili UCS softver za kontrolu van instrumenta |
Port |
8080 |
BaseSpace Sequence Hub ili Illumina proaktivna konfiguracija |
Ulazne veze
Ulazni portovi su podrazumevano zatvoreni. Mogu se otvoriti u MiSeq i100 Plus kontrolnom softveru. Pogledajte Podešavanja zaštitnog zida.
Veza |
Vrednost |
Svrha |
---|---|---|
Port |
80 |
Softver za kontrolu van instrumenta (sertifikat) |
Port |
443 |
Softver za kontrolu van instrumenta (korisnički interfejs) |