Upravljanje obradom

Kartica Planned (Planirano) prikazuje obrade lokalno ili u oblaku. Možete planirati radove lokalno na MiSeq i100 Plus instrumentu preko Illumina Run Manager-a. Da biste planirali obrade u oblaku, koristite BaseSpace Sequence Hub.

Možete da uredite ili izbrišete lokalno planirane obrade na kartici Planirano. Da biste uredili planiranu obradu, izaberite obradu na kartici Planirano. Da biste izbrisali planiranu obradu, izaberite ikonu elipse u koloni Actions (Radnje).

Na kartici Planirano su prikazane sledeće informacije:

•

Status – Status sekvenciranja obrade. Planirane obrade mogu postojati u jednom od sledećih statusa:

–

Planirano – obrada je dostupna za izbor sekvenciranja.

–

Planirano – obrada nije dostupna za izbor sekvenciranja.

–

Potrebna je pažnja – obrada nije dostupna zbog greške (npr. veza sa oblakom je prekinuta). Pregledajte grešku na ekranu sa detaljima obrade.

•

Naziv obrade – naziv obrade.

•

Application (Aplikacija) – Aplikacije za sekundarnu analizu DRAGEN povezane sa obradom. Više informacija o instaliranju aplikacija potražite u odeljku Aplikacije.

•

Poslednje izmene – Datum i vreme kada je obrada poslednji put izmenjena.

Kartica Aktivno prikazuje sve analize u progresu. Kartica Aktivno uključuje započeto sekvenciranje datuma, status sekvenciranja, % ≥ Q30, prinos i ukupno očitavanje PF metrike.

Izaberite naziv obrade da biste se kretali do stranice sa podacima o pokretanju i videli dodatne detalje o obradi. Izaberite padajuću listu pored analize da biste videli dodatne detalje o statusu sekvenciranja i povezanim aplikacijama DRAGEN.

Za više informacija o metrikama i statusu obrade, pogledajte odeljak Praćenje napretka obrade.

Kartica Completed (Završeno) prikazuje obrade koje su završile sekvenciranje i analizu, otkazane ili nisu uspele da završe sekvenciranje ili analizu. Možete da vidite lokaciju podataka o sekvenciranju i analizi izlaza, metriku sekvenciranja i količinu skladištenja podataka instrumenta koju troši obrada. Možete da vidite aplikacije za DRAGEN povezane sa obradom, % ≥ Q30, prinosom, ukupnim očitavanjem PF-a i prostorom na disku koji obrada zauzima na instrumentu. Kada se podaci o sekvenciranju izbrišu ili prenesu sa instrumenta, prostorna metrika prikazuje 0 GB.

Da biste prikazali dodatne rezultate obrade, kao što su detaljno sekvenciranje i sekundarne analize, izaberite obradu.

Instrument je dizajniran da privremeno čuva podatke o obradi sekvenciranjem, a završene obrade će možda morati da se izbrišu da bi se stvorio prostor za naredne.

1.

Izaberite ikonu menija u gornjem levom uglu.

2.

Izaberite Runs (Obrade).

3.

Da biste izbrisali obradu koju želite, izaberite ikonu elipse u koloni Action (Radnja).

4.

Izaberite nešto od sledećeg.

•

Brisanje podataka o obradi – briše fascikle sekvenciranja i analize, ali ne uklanja obradu sa kartice Završeno. Možete da vidite detalje obrade, ali ne možete da vidite izveštaj DRAGEN sekundarne analize.

•

Brisanje obrade – briše podatke o obradi i uklanja je sa kartice Završeno.

5.

U dijaloškom okviru, potvrdite brisanje obrade.

Funkcija ponovnog stavljanja u red čekanja je dostupna samo za obrade koje ostaju na instrumentu. Kada se podaci izbrišu iz instrumenta, ne može se ponovo staviti u red čekanja.

1.

Izaberite ikonu menija u gornjem levom uglu.

1.

Izaberite Runs (Obrade).

2.

Izaberite karticu Completed (Završeno).

3.

Izaberite sekvenciranja obrade za koje treba da se traži odgovor.

4.

Idite u odeljak Secondary analysis (Sekundarna analiza).

5.

Izaberite Requeue Analysis (Ponovo stavi analizu u red čekanja).

6.

Konfigurišite podešavanja analize upita tako što ćete pratiti uputstva u softveru.

7.

Izaberite Requeue Analysis (Ponovo stavi analizu u red čekanja).