Nätverksöverväganden

Sekvenseringssystemet NextSeq 1000/2000 är utformat för att användas med ett nätverk. Kontrolldatorn för NextSeq 1000/2000 kör CentOS med SELinux aktiverat. NextSeq 1000/2000 har inte stöd för kryptering.

För att utföra en körning i manuellt läge krävs en nätverksanslutning för att överföra data från körningen till en nätverkslagringsplats. Illumina rekommenderar att körningsdata sparas på en extern enhet eller nätverksenhet. Den lokala hårddisken på sekvenseringssystemet NextSeq 1000/2000 är avsedd för tillfällig lagring innan data överförs automatiskt.

En internetanslutning krävs för följande åtgärder:

• Överföra instrumentets prestandadata för Illumina Proactive Support (mer information finns i Teknisk dokumentation för Illumina Proactive (dokumentnr 1000000052503).
• [Valfritt] Få fjärrhjälp från Illuminas tekniska support.

Säkerhet och nätverk

Vi rekommenderar att du granskar Illuminas bästa säkerhetspraxis på Illumina Instrument Control Datorsäkerhet och nätverk (dokumentnr 1000000085920) för att hålla ditt instrument säkert. Dessa bästa praxis inkluderar till exempel att aktivera brandväggar och använda lämpliga kontoinställningar.

Följ rekommendationerna nedan för att installera och konfigurera en nätverksanslutning:

• Använd en dedikerad anslutning på 1 gigabit mellan instrumentet och ditt lokala datahanteringssystem. Den här anslutningen kan göras direkt eller via en hanterad nätverksswitch.
• Erforderlig bandbredd för en anslutning är som följer.
– En intranätbandbredd på 200 Mbit/s per instrument för lokal lagring.
– En minsta internetbandbredd på 5 Mb/s per instrument för nedladdning av kontrollprogrammet NextSeq 1000/2000 och DRAGEN arbetsflöden (ca 15 GB). Nedladdningstiden avbryts efter sex timmar. En internetbandbredd på 35 Mbit/s per instrument krävs för att utföra nedladdningen på en timme.
– En internetbandbredd på 10 Mb/s per instrument för BaseSpace Sequence Hub molnlagring (inklusive Illumina Proactive Support).
– En internetbandbredd på 5 Mbit/s per system för körningsövervakning eller Illumina Proactive Support.
• Switchar måste övervakas.
• Nätverksutrustning som switchar måste ha en minsta kapacitet på 1 gigabit per sekund.
• Beräkna den totala kapaciteten för belastningen av varje nätverksswitch. Antalet instrument och mängden kringutrustning som är anslutna, som en skrivare, kan påverka kapaciteten.
• Isolera i möjliga fall sekvenseringstrafiken från annan nätverkstrafik.
• Illumina rekommenderar användning av CAT-6-kablar (minimikravet är CAT-5e). Kontrollera att nödvändiga kablar är tillgängliga innan du påbörjar installationen.

Illumina installerar inte nätverksanslutningar och tillhandahåller ingen teknisk support för dessa.

Granska nätverksarkitekturen för eventuella kompatibilitetsrisker med Illumina-systemet, inklusive följande faktorer:

• Möjlig IP-adresskonflikt – Sekvenseringssystemen NextSeq 1000/2000 tilldelar slumpmässiga interna IP-adresser inom 169.254.0.0/16, vilket kan orsaka systemfel vid konflikter. Kontrollprogrammet NextSeq 1000/2000 v1.2.0 och senare har ett virtuellt nätverksgränssnitt kallat Docker, med standard-IP-adressen 172.17.0.1/16.
• IP-tilldelning – Sekvenseringssystemen NextSeq 1000/2000 har stöd för DHCP eller statisk IP tilldelning.

Följande tabeller anger kontrolldatorns nätverksportar och domäner. Använd tabellerna som en referens när du konfigurerar nätverket.

Anslutning

Värde

Användningsområde

Beteckning för operativsystem

enp5s0

Kommunikation mellan interna komponenter (konfigurera eller ändra inte efter installationen).

Domän

localhost:*

Alla portar för localhost-till-localhost-kommunikation som behövs för interprocesskommunikation.

Port

8081

Real-Time Analysis

8080

Kontrollprogrammet NextSeq 1000/2000

29644

Universal Copy Service (UCS)

Anslutning

Värde

Användningsområde

Beteckning för operativsystem

enp6s0

Prioriterad Ethernet-port för internet (höger port sett från instrumentets baksida)

enp2s0

Prioriterad Ethernet-port för valfri andra nätverksanslutning, t.ex. NAS eller annan nätverkslagring (vänster port sett från instrumentets baksida)

Port

443

Konfiguration av BaseSpace Sequence Hub eller Illumina Proactive

Information om de regionala plattformsdomänerna som ger åtkomst från Universal Copy Service till (BaseSpace Sequence Hub) och Illumina Proactive finns i Säkerhet och nätverk för kontrolldator för Illumina-instrument.