Konfigurera sekundäranalys

NovaSeq X- och NovaSeq X Plus-systemet låter dig utföra flera DRAGEN-analyser i en enda sekvenseringskörning. Innan du konfigurerar sekundäranalys ska du se till att du har installerat rätt DRAGEN-applikation på instrumentet. Mer information om installation av DRAGEN-applikationer finns i Install Applications.

Du kan skapa upp till 12 analysapplikationer och referensgenomkombinationer med ytterligare en BCL Convert-only-applikation. För varje kombination kan du använda upp till 32 konfigurationer med en annan biblioteksprepareringssats, indexadaptersats eller konfigurationsinställningar för en analysapplikation och referensgenomkombination som redan används. 

Följande kombinationer ingår i begränsningen på 12 konfigurationer:

• Samma analysapplikation och applikationsversion med ett annat referensgenom
• Samma referensgenom med en annan applikation eller applikationsversion
• En annan applikation eller applikationsversion med ett annat referensgenom

Konfigurera sekundär analys enligt följande.

1. Välj en applikation och ange följande konfigurationsinställningar för din körning:
• [Valfritt] Konfigurationsbeskrivning
• Biblioteksprepareringssats
• Indexadaptersats
• Referensgenom (ej tillämpligt för DRAGEN BCL Convert)

När en Illumina biblioteksberedningssats väljs fylls adaptersekvenserna för Adapteravläsning 1 och Adapteravläsning 2 i automatiskt och kan inte ändras. Åsidosatta cykler fylls också automatiskt i.

2. Ange ytterligare analysinställningar efter behov. Vilka inställningar som är tillgängliga eller krävs varierar beroende på applikation, applikationsversion och valda konfigurationsinställningar. Mer information om DRAGEN-sekundäranalys finns på supportsidan för Illumina DRAGEN Bio-IT Platform.
3. Använd ett av följande alternativ för att ange provinformation:
• Importera provinformation genom att hämta CSV-mallen, lägg till din provinformation och importera den redigerade CSV-filen.
• Klistra in prov-ID och antingen indexplattans brunnspositioner eller i7- och i5-index direkt från en extern fil. Lägg till ytterligare provrader efter behov innan du klistrar in dem. Prov-ID:n kan innehålla upp till 20 alfanumeriska tecken, bindestreck och understreck.

För indexplattor med fast layout måste brunnspositionerna anges. För index som inte har en fast layout måste i7- och i5-index anges. i5-index måste anges framåtriktade.

• Ange prov-ID och motsvarande brunnspositioner eller index manuellt. Om Not Specified (Ej angivet) är valt för biblioteksprepareringssatsen ska du ange Index 2 (i5)-sekvenser framåtriktade.
4. Slutför körningskonfigurationen.
• Om du vill redigera körningsinformationen senare väljer du Save as draft (Spara som utkast).
• Välj Save as Planned (Spara som planerat) för att slutföra körningsinformationen och göra körningen tillgänglig för sekvensering.