Ağ Bağlantıları
Illumina sistemleri, sekanslama aktivitesi sırasında düzenli bir tempoda veri akışı yapmak üzere tasarlanmıştır. Boşaltma hızına bağlı olarak bu veri iletimi, sekanslamanın tamamlanmasından sonra bir süre devam edebilir. Illumina cihazları çoğunlukla yukarı yönlü bir ağ varsayar. Ağ kesintileri veri iletimini etkileyebilir. Bir ağ kesintisi meydana gelirse, cihazlar tüm verileri yerel olarak önbelleğe almak üzere tasarlanmıştır. Ancak, bu tür önbellek, cihazdaki depolama alanına bağlı olarak bir sonraki sekanslama çalıştırmasının başlamasını geciktirebilir. Cihazlar, ağın geri yüklenmesinden sonra veri aktarımını yeniden başlatmak üzere tasarlanmıştır.
MiSeq i100 Plus System’a ilişkin olası uyumluluk riskleri için ağ bakım faaliyetlerini gözden geçirin.
Her dosya türüne ilişkin veri depolama gereksinimleri hakkında bilgi için bkz. Illumina Cihaz Kontrol Bilgisayarı Güvenliği ve Ağı.
Bir ağ bağlantısı kurmak ve yapılandırmak için aşağıdaki yönergelerden faydalanın:
• | Cihaz ve veri yönetimi sistemi arasında özel bir bağlantı kullanın. Cihazla birlikte verilen Ethernet kablosunu kullanın. Bu bağlantının doğrudan veya bir ağ anahtarı üzerinden olmasını sağlayın. |
– | Veri aktarım sürelerini korumak için saniye başına 1 gigabit (Gb/sn) intranet bağlantısı (ağ depolama ve sınır güvenlik duvarına yönelik cihaz) gereklidir. Daha düşük bağlantı hızları, cihaz kullanılabilirliğinde azalmaya, veri aktarım sürelerinde artışa neden olur ve sekanslama çalıştırma performansını etkileyebilir. |
– | İnternet bağlantısı isteğe bağlıdır. |
• | Yönetilen anahtarlar önerilir. |
• | Her bir ağ anahtarındaki iş yükünün toplam kapasitesini hesaplayın. Bağlanan cihazların ve yazıcı gibi yardımcı ekipmanların sayısı kapasiteyi etkileyebilir. |
• | Mümkün olan durumlarda sekanslama trafiğini diğer ağ trafiğinden ayrı tutun. |
• | Ağ bağlantıları için cihaz ile birlikte 3 m (9,8 fit) uzunluğunda korumasız bir ağ kablosu sağlanır. 50 m’den (164 ft) uzun kablolar için CAT-6A kablosu önerilir. |
%85–90 ağ verimliliğine dayalı bağlantılar için cihaz başına aşağıdaki önerilen ağ bant genişliğini kullanın. Birincil analiz dosyaları arasında RTA ve BCL sekanslama çıktı dosyaları bulunur. İkincil analiz dosyaları, cihaz üzerindeki DRAGEN çıktı dosyalarını içerir.
– | Verileri yerel olarak depolamak için saniyede 800 megabit (Mb/sn) (sadece birincil) veya saniyede ~1 gigabit (Gb/sn) (birincil ve ikincil) sürekli ağ bant genişliği. |
– | Birincil analiz verilerini buluta yüklemek için 800 Mb/sn ağ bant genişliği. |
– | Çalıştırmayı izlemek için 15 Mb/sn ağ bant genişliği veya yalnızca Illumina Proactive Desteği. |
MiSeq i100 Plus, cihaz ile ağ depolaması arasında > 1 Gb/sn ağ bağlantısı kullanır. < 1 Gb/sn bağlantısı kullanmak daha uzun kopyalama sürelerine neden olabilir veya sonraki sekanslama çalıştırmalarının başlatılmasını geciktirebilir.
Giden Bağlantılar
Bağlantı |
Değer |
Amaç |
---|---|---|
Port |
53 |
Müşteri DNS sunucularıyla etki alanı adı çözünürlüğü |
Port |
80 |
BaseSpace Sequence Hub veya Illumina Proactive yapılandırması |
Port |
443 |
Cihaz dışı kontrol yazılımı UI veya UCS |
Port |
8080 |
BaseSpace Sequence Hub veya Illumina Proactive yapılandırması |
Gelen Bağlantılar
Gelen portlar varsayılan olarak kapatılır. Bunlar MiSeq i100 Plus Control Software’de açılabilir. Bkz. Güvenlik Duvarı Ayarları.
Bağlantı |
Değer |
Amaç |
---|---|---|
Port |
80 |
Cihaz dışı kontrol yazılımı (sertifika) |
Port |
443 |
Cihaz dışı kontrol yazılımı (UI) |