Opret en planlagt kørsel
Hvis du vil planlægge en ny sekvenseringskørsel, skal du bruge brugergrænsefladen til planlægning af kørsel på instrumentet eller i skyen. Alternativt kan du importere en prøveark v2-fil til at oprette en planlagt kørsel.
Brug om nødvendigt en af følgende muligheder til at generere et prøveark:
| • | Gå til fjernkontrolsoftwaren. Vælg kørselsnavnet, og vælg derefter Export sample sheet (Eksporter prøveark). Vælg Export (Eksporter) for at gemme prøvearket. |
| • | Planlæg en sekvenseringskørsel i BaseSpace Sequence Hub-kørselsplanlægning, og brug lokal lagring. Eksporter prøvearket, når du er færdig med at planlægge kørslen. |
| • | Brug et prøveark, der er placeret i outputmappen i en fuldført sekvenseringskørsel. |
Oprettelse af en kørsel
For at planlægge en kørsel på instrumentet skal du navigere til fanen Planned (Planlagt) på skærmen Runs (Kørsler). I BaseSpace Sequence Hub skal du bruge valgmuligheden for kørselsplanlægning. Angiv de nødvendige oplysninger som angivet i brugergrænsefladen.
|
Kørselsindstilling |
Oplysninger |
||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
Kørselsnavn |
Unikt navn til at identificere kørslen. |
||||||
|
Kørselsbeskrivelse |
Beskrivelse af kørslen. |
||||||
|
Instrumentplatform |
Sekvenseringssystemet (NovaSeq X Series). |
||||||
|
Sekundær analyse |
Angiver placeringen af den sekundære analyse. Analyser sekvenseringsdata i skyen med BaseSpace Sequence Hub eller på instrumentet. |
||||||
|
FASTQ-format |
Følgende outputformater er tilgængelige:
Gælder kun for kørsler, der anvender lokal sekundær analyse. |
||||||
|
Antal cyklusser i hver aflæsning |
Indtast værdier for aflæsning 1, indeks 1, indeks 2 og aflæsning 2. Du kan finde yderligere oplysninger under Antal cyklusser. PhiX-only-kørsel: Indtast 0 i begge indeksfelter. |
||||||
|
Biblioteksrør-id |
Id'et findes på etiketten på biblioteksrørets strimmel. Denne indstilling kan også kaldes et prøvebeholder-id. |
Se Konfiguration af sekundær analyse for oplysninger om konfiguration af sekundær analyse.
Import af prøveark
| 1. | Naviger til fanen Planned (Planlagt) på skærmen Runs (Kørsler). |
| 2. | Vælg Import sample sheet (Importer prøveark), og åbn derefter filen prøveark v2. |
For oplysninger om prøvearkets format og de tilhørende krav henvises til supportsiden for Prøveark v2 Ressourcer.
| 3. | Når prøvearket er valideret, skal du vælge Next (Næste) for at gennemse de importerede kørselsoplysninger. |
Under gennemgang kan de importerede kørselsoplysninger redigeres.
| 4. | [Valgfrit] Udfør en af følgende handlinger: |
| • | For at redigere kørselsindstillingerne eller konfigurationsindstillingerne vælges Edit (Rediger) ved siden af kørslen eller konfigurationen. |
| • | For at slette en konfiguration skal du vælge Delete (Slet) ved siden af konfigurationen og derefter vælge Yes, delete (Ja, slet). |
| • | For at føje en anden analysekonfiguration til kørslen skal du vælge Add another configuration (Tilføj en anden konfiguration). |
| 5. | Vælg en af følgende muligheder for at gemme kørslen: |
| • | For at redigere kørselsoplysningerne senere skal du vælge Save as draft (Gem som kladde). |
| • | Vælg Save as planned (Gem som planlagt) for at afslutte kørselsoplysningerne og planlægge sekvenseringen. |
