Creación de un nuevo experimento

Para crear un nuevo experimento de secuenciación localmente, utilice la interfaz de planificación de experimentos o importe una hoja de muestras. Si va a usar un archivo v2 de hoja de muestras para crear un nuevo experimento, consulte Importación de una hoja de muestras para crear un experimento.

1. Si va a crear un experimento en el instrumento, vaya a la pestaña Planned (Planificados) como se explica a continuación.
a. Seleccione el icono del instrumento para abrir el menú de navegación global.
b. Seleccione Runs (Experimentos) y, a continuación, seleccione la pestaña Planned (Planificados).
c. Continúe con el paso 3.
2. Si crea un experimento en un ordenador conectado a la red, aparece la pestaña Planned (Planificados) después de iniciar sesión.
3. Seleccione Create run (Crear experimento).
4. En el campo Run Name (Nombre del experimento), introduzca un nombre de su preferencia para identificar el experimento actual.

El nombre del experimento puede contener un máximo de 255 caracteres alfanuméricos, espacios, puntos, guiones y guiones bajos.

5. [Opcional] Escriba una descripción para identificar el experimento.

La descripción del experimento no puede contener asteriscos (*), corchetes ([]) ni comas (,).

6. Introduzca el número de ciclos realizados en cada lectura:

El número total de ciclos de lectura y de índice no puede superar el número de ciclos especificado por el kit de reactivos. El límite del ciclo de índice se aplica a los ciclos utilizados como índice, no a los ciclos UMI o a las lecturas recortadas.

• Read 1 (Lectura 1): introduzca como máximo 151 ciclos.
• Index 1 (Índice 1): introduzca como máximo 10 ciclos. En el caso de un experimento solo de PhiX, introduzca 0 en ambos campos de índice.
• Index 2 (Índice 2): introduzca como máximo 10 ciclos.
• Read 2 (Lectura 2): introduzca como máximo 151 ciclos. Este valor suele ser el mismo que el valor de la lectura 1.
7. [Opcional] Indique el ID del tubo de la biblioteca.

El ID del tubo de la biblioteca se encuentra en la etiqueta de la gradilla de tubos de la biblioteca.

8. Seleccione Next (Siguiente).
9. Seleccione su aplicación de análisis.
10. [Opcional] Introduzca una descripción para la configuración.
11. Seleccione sus kits de adaptadores de índice y de preparación de bibliotecas.

Para obtener información sobre cómo añadir kits de adaptadores de índice y de preparación de bibliotecas personalizados, consulte Importación de kits de adaptadores de índice y de preparación de bibliotecas personalizados.

12. Si el campo está disponible, seleccione el genoma de referencia.
13. Seleccione Next (Siguiente) para configurar el análisis secundario y añadir la información de la muestra.

Para obtener más información, consulte Configuración de un análisis secundario.

Antes de la importación, utilice una de las opciones siguientes para generar una hoja de muestras:

• Desplácese al software de control remoto. Seleccione el nombre del experimento y, a continuación, seleccione Sample Sheet (Hoja de muestras). Seleccione Save as (Guardar como) para guardar la hoja de muestras. 
• Planifique un experimento de secuenciación en Illumina Cloud Run Planning (Planificación de experimentos en la nube de Illumina) y utilice el almacenamiento local. Exporte la hoja de muestras después de terminar de planificar el experimento.
• Utilice una hoja de muestras ubicada en la carpeta de salida de un experimento de secuenciación terminado.

Para crear un nuevo experimento de secuenciación localmente con la hoja de muestras, haga lo siguiente.

1. Si va a crear un experimento en el instrumento, vaya a la pestaña Planned (Planificados) como se explica a continuación.
a. Seleccione el icono del instrumento para abrir el menú de navegación global.
b. Seleccione Runs (Experimentos) y, a continuación, seleccione la pestaña Planned (Planificados).
c. Continúe con el paso 3.
2. Si crea un experimento en un ordenador conectado a la red, aparece la pestaña Planned (Planificados) después de iniciar sesión.
3. Seleccione Import sample sheet (Importar hoja de muestras) y, a continuación, abra el archivo v2 de hoja de muestras.

Consulte Recurso de las hojas de muestras v2 para obtener información sobre el formato y los requisitos de las hojas de muestras.

4. Una vez validada la hoja de muestras, seleccione Next (Siguiente) para revisar los detalles del experimento importado.

Durante la revisión, los detalles del experimento importado se pueden editar.

5. [Opcional] Realice cualquiera de las acciones siguientes:
• Para editar los ajustes del experimento o los ajustes de la configuración, seleccione Edit (Editar) junto al experimento o la configuración.
• Para eliminar una configuración, seleccione Delete (Eliminar) junto a la configuración y, a continuación, seleccione Yes, delete (Sí, eliminar).
• Para añadir otra configuración de análisis al experimento, seleccione Add another configuration (Añadir otra configuración).
6. Para guardar el experimento, seleccione una de las opciones siguientes.
• Para editar los detalles del experimento más tarde, seleccione Save as draft (Guardar como borrador).
• Seleccione Save as planned (Guardar según lo planificado) para finalizar los detalles del experimento y planificar la secuenciación.