Cebadores a medida

Siga las instrucciones de configuración de ejecución descritas en la sección Run Settings (Configuración de ejecución). El uso de cebadores a medida para una ejecución en un sistema de secuenciación Illumina iSeq 100 requiere tres pasos adicionales en la configuración de la ejecución:

• Configure el iSeq 100 en modo de ejecución manual y habilite la configuración de cebadores a medida.
• Seleccione los cebadores a medida en el software de control durante la configuración de la ejecución.
• Prepare y agregue el volumen adecuado de cada cebador a medida al depósito de la biblioteca del cartucho después de completar las verificaciones previas a la ejecución.

Para utilizar cebadores a medida con los kits de reactivos iSeq 100 i1 v2, actualice e instale el software de control iSeq 100 v3.0 o posterior. Las páginas de soporte del sistema de secuenciación iSeq 100 en el centro de soporte de Illumina proporcionan recursos adicionales del sistema.

El iSeq 100 permite el uso de dos cebadores de lectura a medida y dos combinaciones de cebadores de índice a medida. Cada cebador se carga en el depósito de la biblioteca individualmente.

Según el kit de preparación de la biblioteca, es posible que deba usar mezclas de cebador Illumina. Consulte la sección Cebadores a medida VP10 y VP14 para obtener más información.

Illumina no puede garantizar el rendimiento o la compatibilidad de los cebadores a medida. Usted es responsable de validar los cebadores a medida para la secuenciación en el sistema de secuenciación iSeq 100.

Para utilizar cebadores a medida, actualice e instale el software de control iSeq 100 v3.0 o posterior. El iSeq 100 debe configurarse en modo de ejecución manual. Local Run Manager no es compatible con cebadores a medida. Consulte la sección Configuración de una ejecución de secuenciación (modo manual) para obtener más información.

1. En el menú del software de control, seleccione System Settings (Configuración del sistema).
2. Seleccione la pestaña Customization (Personalización).
3. Seleccione la opción Enable custom primers (Habilitar cebadores a medida).
4. Seleccione Save (Guardar) y luego seleccione Exit (Salir).

Cuando se seleccionan cebadores a medida durante la configuración de ejecución, el software indica al sistema que extraiga reactivos del depósito de la biblioteca. Los cebadores Illumina no se utilizan para la lectura o el índice durante la ejecución de secuenciación. Los cebadores Illumina hacen referencia a los cebadores que ya se encuentran en los pocillos del cartucho de reactivos.

Si no se utilizan cebadores Illumina para la Lectura 1 o la Lectura 2, el control PhiX opcional no se secuencia.

Aunque el PhiX no está indexado, proporciona datos de secuenciación durante la lectura del índice. Los datos de secuenciación del control PhiX no se generan durante la lectura de índice, independientemente del cebador de indexación que se utilice.