Izrada nove Obrade
Da biste stvorili novu obradu sekvenciranjem lokalno, upotrijebite sučelje za planiranje obrade ili uvezite list s uzorcima. Ako upotrebljavate datoteku s listom s uzorcima v2 za stvaranje nove obrade, pogledajte odjeljak Uvezite list s uzorcima za stvaranje obrade.
Izrada obrade
| 1. | Ako stvarate obradu na instrumentu, idite na karticu Planned (Planirano) kako slijedi. |
| a. | Odaberite ikonu instrumenta da biste otvorili globalni navigacijski izbornik. |
| b. | Odaberite Runs (Obrade), a zatim odaberite karticu Planned (Planirano). |
| c. | Prijeđite na korak 3. |
| 2. | Ako stvarate obradu na umreženom računalu, kartica Planned (Planirano) prikazuje se nakon prijave. |
| 3. | Odaberite Create run (Stvori obradu). |
| 4. | U polje Run name (Naziv obrade) unesite naziv svoje preferencije kako biste identificirali trenutačnu obradu. |
Naziv obrade može sadržavati najviše 255 alfanumeričkih znakova, razmaka, točaka, crtica i podcrta.
| 5. | [Neobavezno] Unesite opis obrade. |
Opis obrade ne može sadržavati zvjezdice (*), zagrade ([ ]) ili zareze (,).
| 6. | Unesite broj ciklusa provedenih u svakom očitanju: |
Ukupan broj ciklusa očitanja i indeksnih ciklusa ne može premašiti broj ciklusa navedenih u kompletu reagensa. Ograničenje indeksnih ciklusa primjenjuje se na cikluse koji se koriste kao indeks, a ne na UMI cikluse ili skraćena očitanja.
| • | Read 1 (Očitanje 1) – unesite neku vrijednost do 151 ciklusa. |
| • | Index 1 (Indeks 1) – unesite neku vrijednost do 10 ciklusa. Za obradu samo za PhiX, unesite 0 u oba polja indeksa. |
| • | Index 2 (Indeks 2) – unesite neku vrijednost do 10 ciklusa. |
| • | Read 2 (Očitanje 2) – unesite neku vrijednost do 151 ciklusa. Ta je vrijednost obično ista kao vrijednost očitanja 1. |
| 7. | [Neobavezno] Unesite ID cijevi biblioteke. |
ID epruvete biblioteke nalazi se na naljepnici trake epruvete biblioteke.
| 8. | Odaberite Next (Dalje). |
| 9. | Odaberite svoju aplikaciju za analizu. |
| 10. | [Neobavezno] Unesite opis konfiguracije. |
| 11. | Odaberite komplete za pripremu biblioteke i prilagodnika indeksa. |
Za informacije o dodavanju kompleta za pripremu biblioteke i prilagodnika indeksa pogledajte Kompleti za pripremu i prilagodnik indeksiranja za uvoz prilagođene biblioteke.
| 12. | Ako je polje dostupno, odaberite referentni genom. |
| 13. | Odaberite Next (Sljedeće) da biste konfigurirali sekundarnu analizu i dodali podatke o uzorku. |
Za više informacija pogledajte Postavljanje sekundarne analize.
Uvezite list s uzorcima za stvaranje obrade
Prije uvoza upotrijebite jednu od sljedećih opcija za generiranje lista s uzorcima:
| • | Idite na softver za daljinsko upravljanje. Odaberite naziv obrade, a zatim odaberite Sample Sheet (List s uzorcima). Odaberite Save as (Spremi kao) da biste spremili list s uzorcima. |
| • | Planirajte obradu sekvenciranjem u Illumina Cloud Run Planning (Planiranju obrade u Illumina oblaku) i upotrijebite lokalnu pohranu. Izvezite list s uzorcima nakon što završite s planiranjem obrade. |
| • | Upotrijebite list s uzorcima koji se nalazi u izlaznoj mapi dovršene obrade sekvenciranjem. |
Da biste stvorili novu obradu sekvenciranjem lokalno pomoću lista s uzorcima, učinite sljedeće.
| 1. | Ako stvarate obradu na instrumentu, idite na karticu Planned (Planirano) kako slijedi. |
| a. | Odaberite ikonu instrumenta da biste otvorili globalni navigacijski izbornik. |
| b. | Odaberite Runs (Obrade), a zatim odaberite karticu Planned (Planirano). |
| c. | Prijeđite na korak 3. |
| 2. | Ako stvarate obradu na umreženom računalu, kartica Planned (Planirano) prikazuje se nakon prijave. |
| 3. | Odaberite Import sample sheet (Uvezi list s uzorcima), a zatim otvorite datoteku lista s uzorcima v2. |
Za informacije o formatiranju i zahtjevima lista s uzorcima pogledajte Resurs lista s uzorcima v2.
| 4. | Nakon provjere valjanosti lista s uzorcima odaberite Next (Sljedeće) da biste pregledali uvezene pojedinosti o obradi. |
Tijekom pregleda uvezene pojednosti o obradi mogu se uređivati.
| 5. | [Neobavezno] Izvršite bilo koju od sljedećih radnji: |
| • | Za uređivanje postavki obrade ili postavki konfiguracije, odaberite Edit (Uredi) pored obrade ili konfiguracije. |
| • | Da biste izbrisali konfiguraciju, odaberite Delete (Izbriši) pored konfiguracije, a zatim odaberite Yes, delete (Da, izbriši). |
| • | Da biste ciklusu dodali drugu konfiguraciju analize, odaberite Add another configuration (Dodaj drugu konfiguraciju). |
| 6. | Za spremanje obrade odaberite jednu od sljedećih opcija. |
| • | Da biste kasnije uredili pojedinosti obrade, odaberite Save as draft (Spremi kao nacrt). |
| • |
|
